• 序章
• 第一 二章 夢 醒了和黑色組織
• 第三章 訓練結束
• 第四章 離開黑暗
• 第五章 生死離別
• 第六章 真正的家
• 第七章 溫暖的家
• 第八章 一起學習
• 第九章 再三封印
• 第十一章 幸福！昏迷！
• 第十二章 第一個朋友
• 第十三章 雲霄飛車殺人事件
• 第十四章 新一變柯南的第一次案件
• 第十五章 迷茫的未來
• 第十六章 偶像密室殺人事件 上
• 第十七章 偶像密室殺人事件 中
• 第十八章 偶像密室殺人事件 下
• 第十九章 日常生活
• 第二十章 新幹線大爆破事件
• 第二十一章 情人節事件