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三年之後，慕言讓二十五名選出來的弟子守住瓊華，然後讓另外一百五十名弟子，每十人一個大隊，兩人為一小組潛入各國打探情報。[【第&九^中文D9cn.net】
最後經過所有人又是三年的不懈努力，成功阻止曉的挑撥。
帶土一怒之下改變策略，尋找其他成員加入。
用直接潛入的辦法，收服人柱力。
就在同一時間，止水被團藏奪眼，為了宇智波和木葉的和平，他選擇了自殺身亡。
他的自殺，讓宇智波鼬開啟了萬花筒寫輪眼。
而且在寧死前說出南賀神社秘石裏麵藏有三件神器，他把這三件神器和自己的眼睛托付給了宇智波鼬，還讓鼬最好不好使用須佐能乎。
因為須佐能乎會吞噬人的心智，這就是止水為什麽不用須佐能乎的原因。
帶土怎麽也沒有想到，宇智波鼬居然成功破解南賀神社秘石封印，神器被宇智波鼬所得。而帶土之所以沒拿到神器，那是因為他是十三歲才開眼，精神力不夠，破解不了秘石的封印。
他為了使宇智波鼬變得墮落為他所用，殺了宇智波所有人，最後假裝想要殺了放學的佐助，宇智波鼬成功使用出須佐能乎與他一戰。
帶土成功遁走，心智迷失的宇智波鼬，殺了自己的父母。
就在他想要殺了佐助的時候，慕言及時趕到，把宇智波鼬成功喚醒。
宇智波鼬為了給父母報仇，甘願潛入曉當臥底。
就在這時，照美冥聯絡慕言，慕言趕了過去，帶領大家跟三尾戰鬥。
戰鬥剛要打響，玲羽也發出了緊急聯絡信號。
兩軍對戰，臨陣換帥乃是兵家大忌，慕言無法離開，隻能派龍溟回轉。
可惜三尾實力太強，最後雖然被慕言所殺，但慕言用盡了法力，三尾準備逃走，被帶土所擒。
就在這時，河豚鬼從一旁殺出，目標是照美冥。
照美冥查克拉早就不夠，慕言焚心劍還在三尾身上來不及拔出，用剛恢複的一絲法力使用禦風訣用身體替照美冥擋下了這一擊，順手給了河豚鬼一拳。
河豚鬼被一拳打成重傷，最後被鬼鮫所殺。
照美冥雖然被慕言所救，但慕言後背的傷口觸目驚心，英雄救美橋段雖老，但十分有效。
慕言成功捕獲少女芳心。
這點傷對慕言實在不算什麽，回轉之時發現白絕和蠍正在進攻瓊華，卻被龍溟和玲羽聯手擊退。
三天之後，慕言傷已完好如初，佩恩被十尾所侵蝕，想抓九尾，被趕來的慕言與他對決，對戰中佩恩消耗過大，被慕言成功喚醒。
本以為皆大歡喜，可是長門卻突然被帶土偷襲，失去了輪回眼，小南用丹藥救人，成功帶著長門逃了出來。
長門失去眼睛，不過身體已經恢複如初。
慕言遇到自來也，恢複到七轉七層，從蛤蟆口中得知，天地靈氣和自然能量不是同一個世界的東西，所以慕言無法感知自然能量，這個世界的人也無法感知天地靈氣。
恢複功力的慕言帶著龍溟直接約見大蛇丸，龍溟輕鬆擊敗大蛇丸，得知龍地洞的位置，最後恢複到八轉四成。
不過大蛇丸卻知道了慕言的秘密，研製出了完美的穢土轉生，可以複活所有忍界英雄，包括斑，和金角銀角。
同時帶土也得到眼睛發起總攻，沒想到河之國卻成了一道屏障。
不過五大國隻有三代火影和照美冥帶人支援。
慕言斬了死神，複活四代，破了變形山結界，救出猿魔。
加上陣法與一百五十名可以禦劍的弟子。
帶土無法攻破，最後沒有辦法，隻好先攻破其他三國，除了九尾，所有尾獸都已經有了。
利用金角銀角的力量，將十尾複活。
其他三國剩餘的人，全部轉移到火之國。
河之國成了決戰場地。
有了空間之力的陰陽五行八卦陣，卻成了一座堡壘，加上慕言恢複的空間之力，吸收所有白絕的靈氣恢複到八轉九層。
斑解除穢土轉生，最後，慕言用空間之力擊敗帶土。
斑成功奪眼，奪眼之後，與五影一戰，綱手被斑斬成兩段，卻被龍溟所救，綱手終於愛上龍溟。
慕言擊敗十尾，很快趕來與斑一戰，斑吸收十尾，變成六道之力的斑。
慕言用出從來沒使用過的軒轅劍，驚天一劍將斑劈成重傷。
黑絕乘機偷襲，輝夜姬重現人間。
慕言早就知道，用離魂陣，剝離出輝夜體內的邪惡氣息。
輝夜恢複神智。
邪惡氣息凝聚成須佐能乎。
原來須佐能乎三千年前率領八百萬眾神，進攻東方神界，剛好碰到封神榜冊封完畢，被托塔李天王，哪吒，楊戩，四大天王直接擊退。
利用自己的空間之力，逃到了這個地方。
在這個世界，他殺了自己的哥哥天照，把姐姐月讀封印在了宇智波的石碑裏麵。
在殺天照的時候，被天照大神寧死反撲消耗完了他的神力，他神力虛脫最後化身成為神樹。
兩千年後，輝夜奉命前來找天照等神，被眾神合力送來這個空間。
在這裏，他發現了神樹，知道了一切。
可惜在這個途中，他愛上了一個人類。
人類開始了無休止的戰爭。
她想要保護這裏的每一個人，可惜她來這裏之後時候，神力消耗的差不多了。
須佐能乎騙她吃下果實。
吃下果實的輝夜，身上有了須佐能乎的力量。在生下羽村和羽衣的時候，須佐能乎成功壓製輝夜的靈魂，奪得身體控製權。
六道仙人已經有了須佐能乎的邪惡力量，他雖然能壓製這股力量，但他兒子不能。
宇智波一族就是有邪惡力量的子孫。
被控製了的輝夜，把所有人都改造了一遍。
可惜天地靈氣不是這個世界的東西，她做實驗用了很大一部分。
最後終於成功了，輝夜一族的確是她的失敗品。
須佐能乎吸收了六道之力，輪回眼，萬花筒寫輪眼，輝夜的空間之力和宇智波一族七種須佐能乎的力量。
恢複善良的輝夜姬，幫助慕言加入戰鬥。
慕言，龍溟，輝夜經過一番苦戰，終於戰勝了所有能力集合一體的須佐能乎，可惜須佐能乎回光返照十拳劍偷襲慕言，卻被玲羽所擋。
玲羽陣亡。
十拳劍所殺，直接傷及靈魂，無法複活。
慕言一怒之下，全力一劍終於斬了須佐能乎。
就在靈魂要消散的那一刻，龍溟提醒，用金角銀角手中搶的金葫蘆保住玲羽的靈魂，回去讓天尊想辦法。
慕言隻有八轉九層，不過輝夜的空間之力的確了得，在所有忍界忍者的幫助下，開啟了回地球的通道。
慕言悲傷的帶著猿魔龍溟和玲羽的靈魂回到了現實世界。
照美冥和綱手依依不舍。
就在慕言回去的那一刻，火影世界所有人都失去了對慕言等人的記憶。
三年之後。
這段時間，綱手一直不願意談戀愛，因為她心中住著某人。
照美冥不知為何，有過很多婚約，但都被她推掉。
她經常會做一個夢，夢到自己和一個男人結婚了，可是她隻記得那人的長相，就是說不出那人的名字。
直到有一天，這個男人微笑的出現在她麵前，他的身後還跟著一個冷豔絕美的女子。
她毫不猶豫的撲進了這個男人的懷裏。（完）
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