高昌回鶻又稱西州回鶻或和州回鶻，以從在四五百多年。
    唐鹹通七年（866年），北庭回鶻大首領仆固俊與吐蕃、黠戛斯大戰。
    仆固俊收複西州（今吐魯番盆地）、輪台（今烏魯木齊）、清鎮（今瑪納斯縣），從此建立了西州回鶻國。
    從此以後西州回鶻國首領便稱“西州外生子阿廝蘭汗”。
    西州回鶻國以高昌為冬都，北庭為夏都，天山以北從事遊牧，天山以南從事農耕。
    境內多數信仰佛教，民族多元，有漢、突厥、大仲雲、小仲雲、樣磨、葛邏祿、吐蕃等。
    西州回鶻這種好日子一直過了二百六十多年。
    直到1130年，一支東方敗兵的到來，結束了西州回鶻稱霸西域的局麵。
    1130年耶律大石西行，向當時的西州回鶻大汗畢勒哥借道致書：
    “昔我太祖皇帝北征，過卜古罕城，遣使至甘州，詔爾祖烏母主曰：
    ‘汝思古國耶，朕即為汝複之；汝不能反耶，朕則有之。
    在朕，猶在爾也。’
    爾祖即表謝，以為遷國於此，十有餘世，軍民皆安土重遷，不能複返矣。
    是與爾國非一日之好也。
    今我將西至大食，借道爾國其勿致疑。”
    畢勒哥剛收到信後，耶律大石以兵臨城下。
    畢勒哥在三權衡之後，覺得非契丹之敵，故隻能大開城門，宴請三日，借道耶律大石。
    同時在耶律大石強兵的威脅下，畢勒哥隻能獻馬六百，駱駝一百，羊三千。
    並送子孫為質，為耶律大石附庸。
    但畢勒哥作為西域霸主，怎麽可能接受這種強逼之事。
    在耶律大石西征後，畢勒哥一直在謀劃反遼事宜。
    這個機會還真被畢勒哥給等到了。
    耶律大石西征之初遇到了東喀喇汗王朝的抵抗，耶律大石戰敗，一路退回至西州回鶻國。
    這次畢勒哥抓住機會，趁機掩殺大敗而回的耶律大石軍隊，
    追襲俘虜了耶律大石的將領撒八、迪裏、突迭等人。
    耶律大石一路退回葉密，才逃過一劫。
    第一次西征失敗敗回的耶律大石檢討自己，吸取教訓，不除後患西征等於將自己放在了刀尖上。
    畢勒哥不知道的是他這一次的叛變給回鶻帶來了亡國的命運。
    耶律大石休整過後，開始第二次西征，這一次西州回鶻便成了耶律大石的墊腳石。
    耶律大石征服回鶻後，鑒於本部人馬太稀少的緣故。
    便將一部分回鶻國東方的領土交予回鶻自治。
    西、南部由契丹直轄。
    從此西州回鶻汗國滅亡，留下的隻是屬於遼國內部區域大幅度縮小的高昌回鶻自治屬國。
    且回鶻沒了汗號，隻能接受遼國亦都護官職。
    西州回鶻汗國時其疆域西麵開拓至龜茲（今新疆庫車）以西的阿克蘇，烏什一帶。
    與喀喇汗國接壤，西北至天山，北麵包括準噶爾盆地，南隔塔裏木盆地與於闐為鄰。