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    送走那兩個政府的人後，宋博文在下班後將研究院的所有人都召集到會議室開會。宋博文將國家科學技術管理委員會跟他說的話，向大家又講述了一遍，說明了項目的緣由，經費來源，呈清了利弊，然後讓大家自主選擇。結果出乎宋博文意料的是，研究院裏大部分研究人員都願意跟隨宋博文，一同參與到“海菲默”研究項目中，這其中便有宋博文的助理伊恩?格裏夫，另外隻有少數幾個人要求繼續留在學校研究所工作，宋博文自然也沒有勉強他們。
    一切人員安排好之後，宋博文告別了林玉霞，帶著他的團隊到了新的項目研究基地。宋博文害怕林玉霞擔心，並沒有過多地同她講“海菲默”項目的信息。到了新的研究基地，宋博文更是夜以繼日，全身心地投入到工作之中，從那之後，他便更少回家了。
    看到這裏，宋明憲心裏想道：原來父親參加這個項目也是被脅迫的，並不是出於他自願的。然而，宋曉君看到的這些場景，跟喬納之前同他講述的幾乎完全吻合。所以，這些更加印證了之前喬納對他說的都是真的。
    宋博文在新的研究基地一工作就是十年。在這十年裏，宋博文僅回過家幾次。
    隨著年事漸高，林玉霞便找機會同宋博文商量，說她要回國去與宋明憲同住，宋博文想都沒有想一口便答應了。林玉霞見宋博文一口答應了她的請求，都沒有挽留她便心灰意冷，沒再同宋博文說話，待宋博文回到研究基地後，她便收拾好行李回中國去了。
    事實上，宋博文並不是無情，沒有挽留林玉霞，而是因為他並不知道自己的研究項目何時才能夠完成，宋博文知道自己也無法抽出身來陪她和照顧她，他明白林玉霞回中國去同兒子宋明憲一起生活，是再合適不過的了。隻是，宋博文不知道，自己什麽時候才能與林玉霞再相見，他更不知道的是這一別他們之間竟是永別了。
    宋博文研究的項目便是對人腦信息的輸出、複製、解讀、寫錄和重新再輸入，以實現人類在神經層麵的信息交換，提高交流的準確率和效率。研究開展到第七年的時候，“海菲默”項目研究進入瓶頸期。宋博文他們之前的研究一直局限於腦神經和腦電波方麵，通過研究，宋博文他們發現腦電波的輸出、複製、寫錄和輸入在理論上都是可以實現的，但是唯獨解讀這一環節沒有好的辦法解決。腦電波本質上是腦神經回路裏的生物電，生物電具有不確定性，無法像電腦程序一樣進行編碼和解譯，從而使得研究在解讀環節出現阻礙。經過大半年的研究，宋博文的團隊都沒有任何進展。
    有一天傍晚，經過幾個通宵沒合眼後，宋博文終於堅持不了，趴在辦公桌上睡著了。在那不到兩個小時的睡眠裏，宋博文做了一個非常奇特的夢。宋博文夢到自己獨自一人坐在美國西部大峽穀中，一根近乎圓柱體，隻容得下一個人站立的石柱頂端，石柱高高地聳立在大峽穀中，他可以看到整個峽穀的全貌，但他不敢往下看。而此時沒有太陽，天空中飄著一層如紗一般薄薄的雲。
    那個夢是如此的真實，以至於宋明憲和宋曉君都止不住地顫抖，電腦上顯示他們兩的血壓升高，心跳加快。
    突然，他聽到有一個渾厚的聲音遠遠地從天空中傳來：“你知道自己有罪嗎？”宋博文愣了，看著天空四下張望，不知道是怎麽回事。
    那個聲音又重複了一遍：“你知道自己有罪嗎？”
    宋博文低下頭，害怕地說：“我知道！”
    “說說看！”那聲音說。
    “我沒有盡到一個丈夫和父親的責任，我不是一個好丈夫，也不是一個好父親！”宋博文回答說。
    “不對！”那聲音道。
    “我屈從於自己的心意，替政府做事？”宋博文又想了一會兒說。
    “還是不對！”
    宋博文轉動著眼珠，上天空中張望著，好一會兒才膽怯地說：“那是？”
    “我們曾經竟然是如此的愚蠢……”那聲音空曠而醇厚，在廣闊的大峽穀中慢慢地消散退去。
    宋博文抬頭一看，天上的雲被突然被風攪動著，迅速地形成兩股平行的，旋轉的雲，停留了一會兒後，旋轉的平行雲層又再次散開去。
    宋博文一下子從夢中驚醒，嘴裏不斷地說著：“我有罪！我有罪……”好一會兒，他才清醒過來，發現自己還在辦公室裏麵。
    “原來是一個夢！”宋博文自言自語道，“但是……”
    但是那個夢卻那麽的清晰，那層疊的峽穀，那柱狀的山，還有那飄動的雲。宋明憲和宋曉君都驚出了一身冷汗。
    “雲！”宋博文突然大聲喊道，然後欣喜地從椅子上跳了起來，翻看其自己之前的研究資料來。
    “dna雙螺旋……”
    “四堿基……”
    “腺嘌呤……”
    “鳥嘌呤……”
    ……
    宋博文嘴裏自言自語地念叨著，他又一晚上沒有休息。
    第二天一早，他便將自己昨天晚上的發現同研究基地的同事們講：“dna的結構是天然的四進製，由dna的四種堿基進行編碼，然後進行表達，模擬生物電信號，比起人工編碼的複雜性，信息的不完整性來說，要優越太多了……”
    “這確實是一個很好的思路啊！”
    “那我們就試著朝這方麵進行研究吧！”
    宋博文的同事們也都驚喜地說。於是，他們很快便投入到工作中，沿著宋博文新發現的思路進行研究。很快他們的研究便有了較大的進展，很好的解決了腦電波信息進行生物解讀的問題。至此，在宋博文的帶領下，研究基地實現了人腦信息的輸出、複製和解讀等正向過程，他們便繼續對人腦信息的輸入和寫錄等逆向過程進行進一步的研究。
    這一研究，又是6年過去了。
    此時，宋博文已經67歲了，早已過了花甲之年。他大部分的時間都花在工作上，幾乎都是在研究基地度過的。隨著年紀越來越大，他也越發地思念家人。於是，宋博文一有空便同林玉霞寫信，所說的也都是一些生活瑣事。他會告訴林玉霞自己的近況，還有研究基地的一些趣事，也會打探林玉霞和家人們的情況，表達思念之情。隨著年歲增加，加之平時思念愈重，這個時候的林玉霞身體狀況其實已經大不如前，越來越不好了，但是她在信中並沒有告訴宋博文，隻是叮囑宋博文要：“你我都上了年紀了，要多加注意身體，照顧好自己，不要以為自己還年輕，繼續逞能。”
    在1993年10月22日，農曆重陽節的前一天，林玉霞先宋博文而去，享年64歲。林玉霞的突然離去，讓宋明憲一家人非常地悲痛，宋博文放下手中的一切事情張羅母親的葬禮。
    宋明憲囿於對父親的成見，開始的時候並沒有打算通知宋博文母親去世地消息，但是在妹妹宋淑雲的勸說下，為了不給宋博文留下遺憾，他還是給聖斯坦大學打了一個電話。結果宋明憲被告知宋博文已經很久不在那裏工作了，他又輾轉聯係到宋博文以前在聖斯坦大學的同事，同和宋博文在研究基地的傑弗裏?克拉克，請他務必將林玉霞去世的消息轉告宋博文。傑弗裏也確實將林玉霞去世的消息親口告訴了宋博文，而且宋明憲之後還打電話過去向傑弗裏確認過。但是，在林玉霞的整個葬禮中，宋博文始終都沒有出現，這便是宋明憲一直怨恨宋博文的最主要的原因。從那之後，宋明憲便深深地記恨宋博文，從心底黯然已同宋博文斷絕了父子關係，決定再也不會找他，聯係他了。而從那之後，宋博文也像消失了一般，音信全無。
    那一年宋曉君才10歲，他也比較清楚地記得當時奶奶葬禮的情況，但在他的記憶之中並沒有爺爺的身影。