此時麵對著大清王朝的內外交困，太皇太後葉赫那拉.蘭兒則是派出了恭親王奕昕前往各駐外使節處共同與之談判。
    在經過那場巨大的黃河水災後，太平天國和撚軍各自忙著救災，沒有在主動出擊清王朝，然而葉赫那拉.蘭兒卻認為這是個殲滅撚軍的好機會，因為除了太平天國強大之外，就數撚軍比較弱小，同時撚軍跟太平天國之間也有小磨摖，雙方在相互配合作戰上存在巨大的分歧，同時撚軍雖然較為弱小，但同時也是太平天國的左膀右臂，隻要殲滅了撚軍就相當於斬斷了太平天國的左膀右臂，於是葉赫那拉.蘭兒就欽點浩順郡王僧格林沁帶著大清王朝的十萬八旗精銳，繞過太平天國直擊撚軍心髒，僧格林沁領命後，帶著十萬八旗精銳浩浩蕩蕩地出發了。一路上，清軍紀律渙散，燒殺搶掠之事時有發生，百姓苦不堪言。而撚軍這邊，早已得到清軍來襲的消息，他們憑借著對當地地形的熟悉，巧妙地布置了陷阱。當僧格林沁的軍隊深入撚軍腹地時，突然伏兵四起，喊殺聲震天。八旗精銳在狹窄的山道中難以展開陣型，被撚軍打得節節敗退。僧格林沁心慌意亂，試圖組織反擊，卻始終無法突破撚軍的包圍。與此同時，太平天國得知撚軍被清軍攻擊，雖與撚軍有矛盾，但也深知唇亡齒寒的道理，派出了一支奇兵，從清軍後方發起攻擊。清軍腹背受敵，頓時大亂。於是僧格林沁不顧叁將鈕鈷祿氏.彰泰的勸阻，帶著幾乎所有八旗精銳，直搗撚軍的另一根據地山東曹縣高樓寨，然而此時撚軍名將張宗禹、陳大喜等人早已經布下了天羅地網。
    這一戰，清軍損失慘重，幾乎全軍覆沒，僧格林沁本人的身受重傷，狼狽逃竄於高樓寨的一處隱秘田埂，身受重傷的僧格林沁直接從馬上摔了下來，被埋藏在此的撚軍十六歲青年張皮梗斬殺，就連其頭顱也掛在了城牆上示眾，從而導致葉赫那氏.蘭兒殲滅撚軍的計劃徹底失敗。同時這幾乎是大清王朝八旗軍隊的最後精銳，僧格林沁的死亡，直接宣布大清王朝的八旗軍隊徹底覆滅，使得大清王朝從此隻能依靠四大名臣的湘軍和淮軍葉赫那拉·蘭兒得知僧格林沁戰死、八旗精銳覆滅的消息後，氣得差點昏死過去。朝堂之上，大臣們議論紛紛，有人主張繼續與撚軍和太平天國死戰，有人則建議求和。葉赫那拉·蘭兒強撐著威嚴，心中卻已亂成一團。
    此時，四大名臣之一的曾國藩站了出來，他上奏道：“太後，如今八旗已衰，我湘軍和淮軍雖能暫撐局麵，但長久之計還需改革兵製，編練新軍。且不可再輕易與撚軍、太平天國硬拚，可先安撫各方，再徐圖發展。”葉赫那拉·蘭兒沉思良久，最終采納了曾國藩的建議。
    與此同時，撚軍和太平天國因這次勝利士氣大振，但內部矛盾也逐漸凸顯。太平天國高層認為此次救援撚軍出力甚大，要求撚軍給予更多支持；而撚軍則覺得太平天國之前並未全力合作，雙方關係再度緊張起來。大清王朝則在這間隙中，開始秘密籌備新軍，試圖重新奪回主動權——
    湘軍在曾國藩、左季高和副將曾國荃、曾國祥等人的日夜嚴格訓練之下越來越強大，同時還購置了各種先進的武器和遠程火炮，與此同時，淮軍在李鴻章和張之洞等人的嚴格訓練之下也逐漸變強，湘軍和淮軍加上水師總兵力達到了五十多萬。
    此時的太平天國和撚軍也沒有閑著，在翼王石達開、忠王李秀成等人的帶領下變得軍力增強，軍威嚴謹，士氣高漲，突然有一天，不知死活的法軍前來進犯 ，太平軍在忠王李秀成的帶領下將其徹底擊敗，就連法軍總督戈登也被斬首。
    十年後，曾國藩帶領十五萬湘軍突襲徽州的太平軍大本營，雙方在定遠古城進行了激烈拚殺，此時太平軍在李秀成、石達開帶領下，士氣高漲，全體將士奮勇爭先，直殺的湘軍傷亡過半，人人膽戰心驚，此時曾國藩才認識到石達開和李秀成的厲害，湘軍的失敗傳到了大清朝廷，太皇太後勃然大怒：“著曾國藩將失敗原因上奏，否則就嚴加查辦”焦頭爛額的曾國藩無法，隻得如實寫道：“臣初討太平天國，屢戰屢敗，皆臣之過也，臣甘願受罰！”
    此時一旁的左季高看著曾國藩說道：“曾大人，這樣寫不妥，否則朝廷知道，你我罪責難逃！”你應該這樣寫：“臣征討太平天國，不幸遭此慘敗，然臣並不氣餒，緊接著重整湘軍，屢敗屢戰！”曾國藩聽後眼前一亮，覺得左季高所言極是，便依言修改了奏折呈遞給太皇太後。太皇太後看到“屢敗屢戰”四字，心中怒氣稍減，覺得曾國藩尚有鬥誌，便未過多責罰，隻是嚴令他盡快重整旗鼓。與此同時，撚軍與太平天國之間的矛盾愈發尖銳，在一次資源分配問題上爆發了激烈衝突，雙方甚至兵戎相見。大清王朝得知此消息後，認為有機可乘，葉赫那拉·蘭兒命曾國藩、李鴻章帶領湘軍和淮軍聯合出擊，打算各個擊破。湘軍和淮軍養精蓄銳已久，加上裝備先進，一鼓作氣衝入撚軍和太平軍陣營。撚軍和太平軍因內耗嚴重，戰鬥力大減，麵對清軍的攻勢節節敗退。石達開和李秀成雖奮力抵抗，但也難以挽回頹勢。一場大戰過後，撚軍和太平天國元氣大傷，大清王朝似乎又看到了一絲中興的曙光。
    此時，左季高向大清王朝建議：“由於李鴻章擅長於外交，況且洋務運動也需要人才，建議將李鴻章調回洋務運動處擔任洋務運動全權處理代表，將淮軍交由張之洞統領，太皇太後權衡利弊後，便同意了左季高的建議。
    淮軍換將後，迎來了全麵發展，在一次激戰後，將孤立的撚軍徹底剿滅，剩下的太平天國就如喪家之犬，在湘軍和淮軍的全麵進攻之下，一路敗逃，在撤退到貴州赤水河邊安順場時，早已被數十萬的湘軍和淮軍團團包圍，麵對著滾滾金沙江天塹，石達開和李秀成無計可施，隻得派出謀士前往對岸的四川西昌.瀘定求助當地的彝族，然而由於語言不通，當地的數十萬彝族拒絕了石達開和李秀成的請求，石達開和李秀成心急如焚，而此時湘軍和淮軍開始發動總攻，喊殺聲震得地動山搖。就在這千鈞一發之際，突然天空中烏雲密布，一道奇異的光芒閃過，竟憑空出現一支神秘軍隊。這支軍隊身著奇異服飾，手持先進武器，他們二話不說，直接向湘軍和淮軍發起攻擊。清軍被這突如其來的變故打得措手不及，陣腳大亂。石達開和李秀成見狀，趕緊重整旗鼓，與神秘軍隊裏應外合，竟然逐漸扭轉了局勢。原來，這支神秘軍隊是從另一個時空穿越而來，他們感知到這裏的危機，出手相助。在神秘軍隊的幫助下，太平天國暫時擺脫了困境，石達開和李秀成也看到了新的希望，開始謀劃如何借助這股力量重振太平天國，而大清王朝則又陷入了新的危機之中。
    然而一切皆有天定！非人力可為也！