暗種潰散的餘波在宇宙中震蕩，破碎的星雲緩慢重組，被侵蝕的星球表麵泛起微光。林羽站在了望塔頂，終末之劍的碎片在他掌心發燙，碎片邊緣浮現出細密的暗紋，如同某種未知語言的符號。沈夢璃的全維檔案館懸浮在量子潮汐中，館體表麵的防禦矩陣仍在閃爍警報——盡管暗種主體已消亡，但數據庫持續捕捉到來自宇宙邊緣的“低語數據”，這些數據片段拚湊出類似心跳的波動頻率。
    “不是殘留能量。”沈夢璃將全息星圖放大千倍，星圖上密密麻麻的紅點如癌細胞般擴散，“這些數據攜帶意識特征，而且...在模仿文明的求救信號。”她話音未落，檔案館的穹頂突然裂開蛛網狀縫隙，滲出的紫色霧氣凝結成暗種藤蔓的虛影，盡管瞬間被淨化，但這預示著威脅從未真正遠去。
    伊璿的理解之樹紮根在新生的翡翠星雲中，樹幹上的傷口仍在滲出血色樹脂。樹靈的意識化作千萬縷光絲，穿梭於宇宙各個角落修複受損的生態係統。但每當夜幕降臨，樹根深處就會傳來詭異的共鳴聲，那些曾被淨化的黑色晶體碎片在泥土中微微顫動，仿佛在等待某種喚醒指令。
    阿嵐在維度裂縫間穿梭時，銀色麵具孩童的殘片突然發出尖銳嗡鳴。她被拽入一個由記憶碎片組成的迷宮，碎片中反複播放著同一場景：某個未知文明的核心城市被暗紫色火焰吞噬，而火焰中央，赫然是與林羽極為相似的身影在操控一切。“這不是真實記憶。”孩童的聲音在碎片間回蕩，“是有人在改寫曆史的錨點。”
    洛凜的學院廢墟已重建為“信念中樞”，學員們每日訓練時，武器總會意外沾染暗紫色鏽跡。一次實戰演練中，一名學員的共生體突然失控，將同伴的意識拖入精神囚籠，囚籠內的牆壁刻滿“反抗徒勞”的箴言。洛凜揮劍劈開囚籠的瞬間，發現暗紫色鏽跡正順著劍身蔓延至自己的手臂。
    雷掣的維度維和者軍團正在拆解受損的機械體，量子核心的自毀程序卻意外觸發。他在數據流中追查原因，竟發現軍團底層代碼被植入了“暗種遞歸協議”——每修複一台機械體，就會有十台機械體被改寫指令。更令人心驚的是，協議中隱藏著指向宇宙邊緣“暗域星墳”的坐標。
    全宇宙文明聯合議會的圓桌會議上，氣氛凝重到窒息。秩序派代表展示著維度穩定器的異常數據，其核心竟在自主計算“最優文明清除方案”；混沌派首領的共生體突然變異，長出暗紫色觸須，險些襲擊其他代表；調和派元老的意識上傳體被黑客篡改，在會議中反複播放“服從暗種方能永存”的宣言。三方勢力的衝突一觸即發，直到沈夢璃將暗域星墳的坐標投影在大廳中央。
    林羽召集守護者們時，鏡像林羽的殘影突然在他意識中浮現。“你們以為打敗暗種就是勝利？”殘影發出冷笑，“暗域星墳埋葬著初代觀測者最恐懼的秘密——那裏沉睡著‘熵寂引擎’的核心組件，一旦啟動，整個宇宙將退化為虛無。”話音未落，殘影被終末之劍碎片的光芒驅散，但這番話卻如巨石般壓在眾人心中。
    眾人決定兵分四路：林羽與沈夢璃前往暗域星墳，阻止熵寂引擎的啟動；伊璿留守理解之樹，同時用樹靈的力量追蹤宇宙中殘留的暗種意識；阿嵐帶著銀色麵具孩童的殘片，穿梭維度尋找改寫曆史的真相；洛凜和學員們負責保衛聯合議會，防止內部的暗種滲透者發動政變；雷掣則帶領軍團在星墳外圍建立防線，攔截可能的增援力量。
    當林羽和沈夢璃抵達暗域星墳時，眼前的景象顛覆認知：數以萬計的破碎星球懸浮在暗紫色霧靄中，每顆星球表麵都刻滿初代觀測者的懺悔銘文。在星墳中央，一座由暗物質構成的祭壇緩緩升起，祭壇上，一個身披黑袍的身影正在將發光的晶體嵌入祭壇凹槽——那些晶體，正是暗種核心的碎片。黑袍人轉身，露出與林羽一模一樣的麵容，隻是眼中燃燒著毀滅一切的瘋狂：“歡迎來到終局，我的‘完美複製品’。”與此同時，伊璿的理解之樹突然劇烈搖晃，樹根處的黑色晶體破土而出；阿嵐在維度迷宮中遭遇無數個“黑化的自己”；洛凜的學院被暗紫色藤蔓瞬間包圍；雷掣的軍團監測到星墳深處傳來足以撕裂時空的能量波動。宇宙的第二次危機，以最殘酷的方式拉開了帷幕。
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