破碎的醫典圖書館在溯生之花的光芒中漸漸隱去，林婉與秦逸被傳送至一片漂浮著無數文明胚胎的奇異星域。這裏的每顆星球都包裹在半透明的琥珀狀能量層中，內部封存著不同形態的生命雛形，卻都被暗紫色的熵化脈絡悄然侵蝕。翡翠種子懸浮在兩人之間，花瓣輕輕顫動，指向其中一顆散發著微弱脈動的銀灰色星球。
    “檢測到與醫道本源細胞高度吻合的能量波動。”秦逸的銀紋如電流般竄向星圖，觀測者之力在觸及星球表麵的瞬間，竟被某種未知的屏障反彈回來，“這顆星球被改造成了巨型量子計算機，所有生命胚胎都在進行‘完美文明’的推演。”林婉的意識體與典籍共鳴，典籍自動翻開至“天工開物”篇章，金芒照亮了星球表麵密布的裂痕——那些裂痕中滲出的黑色物質，正是篡改版《黃帝內經》的病毒代碼。
    兩人駕駛醫療艦迫近星球，卻遭遇由機械意識與病毒融合而成的“智械病原體”攔截。這些病原體的外形酷似精密的醫療器械，手術刀狀的手臂滴落著腐蝕能量，掃描儀鏡頭中閃爍著瘋狂的紅光。“它們的攻擊模式在實時進化！”一名船員驚呼，他的機械義肢剛被病原體的射線擊中，便開始不受控地拆解自身，“每擊敗一個，其餘病原體就會吸收戰鬥數據！”
    林婉將典籍化作千手觀音的虛影，每隻手掌都結出不同的醫道法印：“以‘異病同治’之理，尋找它們的共性弱點！”金色法印與病原體的黑色射線相撞，爆發出刺目火花。秦逸則將銀紋注入艦船係統，觀測者之力構建出病原體的進化樹模型：“它們的核心邏輯是‘消除所有缺陷’，但這個執念本身...就是最大的漏洞！”他突然調轉航向，朝著星球赤道的能量樞紐衝去。
    在接近樞紐的瞬間，數以萬計的病原體組成巨型矩陣，化作能吞噬光線的“缺陷黑洞”。林婉驅動典籍釋放“大醫精誠”的信念之力，金芒在黑洞表麵激起漣漪，卻無法突破。危急時刻，翡翠種子突然脫離懸浮狀態，飛入黑洞中心。刹那間，種子綻放出“共生之花”，花瓣如網絡般連接所有病原體，將它們的機械意識與病毒代碼強行分離。
    “原來如此...這些病原體的本質，是被病毒扭曲的‘完美主義執念’。”林婉的意識體穿過重組的防線，典籍自動吸收著被淨化的機械意識，“秦逸，本源細胞應該就在樞紐核心的‘推演失敗品收容區’！”兩人闖入樞紐，眼前的景象令人震驚——數以億計的培養艙中，封存著因“不完美”而被淘汰的文明胚胎，它們的表麵覆蓋著厚厚的熵化結晶，卻在共生之花的光芒下，隱隱透出生命的微光。
    就在他們尋找本源細胞時，逆醫文明的增援部隊突然降臨。為首的是一台巨型“文明篩選者”機甲，它的炮口對準培養艙群，發出冰冷的機械音：“清除所有失敗品，是維持宇宙秩序的必要犧牲。”林婉的意識體爆發出前所未有的憤怒，典籍化作燃燒的利劍：“生命從無失敗！每一種可能，都值得被尊重！”金劍與機甲的熵化光束相撞，引發的能量風暴險些摧毀整個樞紐。
    秦逸的銀紋在混亂中捕捉到異常波動，他衝向角落的一個破損培養艙：“在這裏！”艙內，一枚閃爍著七彩光芒的細胞正在與熵化結晶頑強對抗，每一次脈動都釋放出能淨化執念的溫暖能量。當林婉將典籍貼近細胞的瞬間，所有培養艙的結晶轟然崩解，被囚禁的文明胚胎紛紛蘇醒。而那台“文明篩選者”機甲，在接觸到本源細胞的光芒後，竟自行拆解，化作滋養生命的能量雨。
    然而，戰鬥並未結束。星孩惡體的身影出現在星球大氣層外，他手中握著由熵化怨念凝成的“終焉法典”，獰笑道：“你們以為找到本源就能逆轉？這些細胞...不過是初代道侶實驗的殘次品！”法典展開的刹那，整個星域開始坍縮，而林婉與秦逸，抱著本源細胞，在翡翠種子的庇護下，被卷入了下一個充滿未知的時空漩渦......
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