萬法會結束第七日，劉鎮南在玄冥宗藥圃鋤草時，鋤尖觸到半塊刻著幽冥符文的龜甲。林素衣指尖剛觸及甲片，藥神體質便自發抗拒，原來甲內封印著噬心老祖的殘魂。龜甲傳出嘶啞笑聲，稱幽冥教九大分壇已布下九幽吞天陣，三月後月蝕之夜便是死期。
    當夜子時，劉鎮南在油燈下研讀龜甲符文。燈花爆響時，窗外掠過九道黑影。他取門閂在門前劃出守字訣，門閂觸地竟長成青藤結界。次日清晨，門外躺著七具黑袍屍體，唯兩具化黑煙遁走。藥王穀主見龜甲神色凝重，推演時羅盤炸碎，天機已被蒙蔽。
    劉鎮南將龜甲埋入藥圃東南角，三日後開出墨色曼陀羅，花心浮現陣眼方位圖。林素衣認出這是以毒攻毒之法，需取九大分壇鎮物破陣。首戰黑水鎮，兩人扮遊醫見鎮民眼底泛黑氣。劉鎮南義診時發現噬心蠱，茶館掌櫃暴起發難，毒血引發全鎮異變。
    劉鎮南以藥汁畫淨化符，地氣翻湧退蠱蟲。鎮中祭壇塌陷露血池，九具青銅棺浮起。林素衣擲藥鼎相抗，劉鎮南用義診銅錢布陣，血池倒灌入棺。取走血玉時追蹤蠱發作，幽冥聖女率傀儡圍城。亂葬崗上，劉鎮南埋血玉念往生咒，引爆地脈破敵，取得玉簪鎮物。
    戰後發現九鎮物可拚成星盤，指向極北深淵。玉簪內側刻道成之日，幽冥歸一，暗示兩道同源。療傷時銀針過處傷口長嫩芽，劉鎮南悟救蒼生即大道。然煎藥時罐中倒影，他的影子露出詭異微笑。
    幽冥教主在總壇震怒，祭壇上剩餘八鎮物共鳴震顫。他咬破指尖在骷髏燈上畫符，千裏外劉鎮南懷中龜甲突然發燙。林素衣急取藥王穀淨霜敷上，霜火相激炸開青煙，煙中現出第二分壇位置——沉劍湖。
    沉劍湖底藏著幽冥水獄，鎮物是千年屍王的玄冥珠。兩人租舟垂釣作掩護，魚鉤竟釣起腐屍。水鬼群湧時，劉鎮南將青帝符印刻於船底，舟行處怨靈退散。湖心漩渦中屍王現世，林素衣以藥煉之術化屍毒為靈氣，劉鎮南引雷符劈開屍身取得玄冥珠。
    連破兩壇驚動幽冥長老，他們在第三分壇埋下陷阱。劉鎮南取珠時觸動禁製，地下衝出九陰蝕骨蟲。林素衣灑出藥粉反成蟲群養料，危難間她割腕以藥神血畫陣，蟲群懼血退散。劉鎮南趁機以青帝縛靈訣鎖住鎮物，卻發現是誘餌假珠。
    真的鎮物藏在守壇長老心脈中，需活取而不傷其命。劉鎮南以金針定魂，林素衣施藥護心，取出血蟾蜍時長老竟化作傀儡木偶。傀儡額貼符紙書道高一尺，魔高一丈，顯然早有高人設局。
    連破三壇後，劉鎮南在客棧調息時突遭反噬。體內道韻與幽冥氣相衝，嘔出的血落地生黑蓮。林素衣急煉九轉還魂丹，丹成時天降雷劫。原來自然道進展太快，已觸天道禁忌。
    雷劫中，幽冥教徒趁機偷襲。劉鎮南強撐傷體引雷布陣，借天雷淬體暫壓反噬。雷散後，他發現修為盡失，卻感知到天地道韻更清晰。林素衣扶他下山時，撿到幽冥教密信，上書道消魔長，時機已至。
    密信提及總壇祭壇需九道純陽血氣，而今日正是玄冥宗外門弟子下山曆練之日。劉鎮南大驚，幽冥教最終目標竟是屠戮玄冥新秀！他燃本命精血禦空趕回，見山門處已血流成河。
    混戰中，劉鎮南以凡人之軀擋在弟子前，持枯枝畫太極圖。陰陽流轉間，幽冥教徒招式竟自相矛盾。林素衣將藥神血滴入山泉，泉水化雨治愈傷者。然幽冥教主親臨，袖中飛出九幽噬魂幡。
    噬魂幡罩下時，劉鎮南懷中八鎮物齊鳴，在頭頂結成星盾。星盾噬魂幡相持不下，地底突然裂開，現出青帝遺留的封魔碑。碑文顯示，九幽噬魂幡需以道侶之魂為祭，而林素衣額間浮現獻祭咒印。
    原來她早知此劫，暗中將咒印轉於己身。劉鎮南悲嘯震天，自然道韻與幽冥氣相融，竟使封魔碑蘇醒。青帝虛影再現，指出噬魂幡本是青帝年少所製法器，後墮為魔物。
    道魔本一體，善惡存乎心。青帝點化下，劉鎮南將噬魂幡煉為救世幡。幡展時萬靈複蘇，幽冥教主遭反噬化灰。然林素衣因咒印昏迷不醒，需集齊九轉還魂丹藥材，而最後一味同心蓮長在幽冥教禁地。
    劉鎮南背起林素衣走向禁地，身後跟著幸存的玄冥弟子。眾人不知，禁地深處坐著與青帝容貌相同的黑袍人，正將一朵黑白相間的蓮花放入丹爐。
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