徐輝祖去陝西後，基於各方麵的考慮，經朱元璋同意，朱允炆決定對武學官員、教員進行了大調整，齊泰任兵部左侍郎，何福任平羌將軍，沐晟任後軍左都督，鐵鉉任山東參政。綜合了茹瑺、齊泰、鐵鉉、黃子澄等人的意見，決定讓山東左參政陳迪擔任武司業，左僉都禦史景清為文司業，大理寺司務暴昭為主簿，密雲衛指揮使平安任騎兵教官，山東濟南衛指揮使盛庸為火器教官，大同衛指揮使陳質任步兵教官。這些人裏朱允炆知道的隻有盛庸和平安，所以朱允炆便召集這些人進行了麵談，比較滿意，不由得感慨，開國之初，貴族還沒有腐朽，平民也追求上進，所以文武雙全的極多。另外由於武學的級別較低，陳迪、景清和暴昭的俸祿都有些下降，所以朱允炆征得朱元璋的同意，保留了他們的原有品級和俸祿，至於武學的職位評級，朱允炆無法調整，因為國子監的級別就是如此。

    朱允炆經過這兩天處理政事，逐漸明白維護如此大的一個帝國是多麽的困難，工業水平的落後導致沒有汽車等交通工具，也沒有電報、電話等遠程通訊的手段，從帝都傳往北部的詔令，最快也要一個月才能往複，所以不得不給邊疆將士充分授權，但這又讓京師的皇帝擔心邊疆將士擁兵自重；再者西北缺水，糧食產量很低，在靠人力、畜力和原始道路的情況下，糧食運輸也非常困難，所以自從唐以後，由於水土流失嚴重，關中無法建都，自然也失去了對西北支援的能力，導致五代以後，西北淪入胡人之手。大明建立，雖然努力拓邊，但是也僅到嘉峪關而已，離漢朝的玉門關、陽光相隔有千裏之遙。

    所以朱允炆能想到的辦法，分兩步走，一是提高糧食產量，二就是提高軍隊的戰鬥力。解決辦法就是保持水土，引進良種，使用化肥，發展火器，還有就是研究蒸汽機等等......

    朱允炆最近花了大量的時間在工學院，讓他們用水利器械來碾碎礦石，生產化肥，讓農學院進行測試；再有就是召集一群紡織匠戶，讓他們研究效率更高的紡紗、織布的機器；最後是兵棋方麵，讓火器工匠研究最原始的火炮和手榴彈，好在手榴彈比較容易製造，已經基本定型，火炮也在逐步實驗。為此朱允炆專門指定了工作條例，給工匠極大的自主性，並提供重獎，王全這個工學院院長也逐漸找到了感覺，做事情越來越順，工學院的人員也越來越多，從各地遷入大量的匠戶，導致工部尚書嚴震直都有些不滿，不過好在朱允炆承諾工學院的成果優先提供給工部，嚴震直才滿意而去。

    過了十幾天，朱允炆在批閱奏折時，發現了兵部撰寫的關於府兵和衛所的資料，待批閱完緊急的奏折之後，拿起這個資料詳細的看了一下，發現寫的很詳細，唐府兵的資料主要來自新舊唐書的兵誌，還有南宋陳傅良的《曆代兵製》，衛所也總結是最近的資料。朱允炆看了三遍，對府兵製和衛所有了大致的了解......

    府兵製度，起於西魏而盛於唐，起源於遊牧民族的出則為兵，入則為民的傳統，當鮮卑人入主中原後，鮮卑人逐漸成為府兵，所謂府兵，就是隸屬於軍府的士兵。隨著戰爭的升級和鮮卑人數量的減少，漢人也逐漸成為府兵，到隋、唐，府兵成為正式的軍事製度。唐時，在關內外設六百三十四折衝府，關內道多達二百六十一府，上府兵1200人、中府兵1000人、下府兵800人，全國府兵共計60餘萬人，府兵從農民中選出，授以田畝，二十歲到六十歲服役，免除所有賦稅，平時務農，戰時出征，但武器、戰馬和衣食要自備。這種製度的優點是國家軍費負擔很輕，且將兵分離，沒有擁兵自重的問題。

    但府兵製也存在很多問題，府兵製以遊牧民族的兵製為藍本，所以和強盜差不多，如果出征沒有獲勝，得不到賞賜，或者出征時間太長會導致繳獲相對減少，那麽府兵就會越來越窮困，進而影響府兵的鬥誌和戰鬥力，如果戰死的府兵太多，會讓農人望而卻步，無法補充府兵。所以府兵製在國家整體戰略轉攻為守時，就會出現問題，防守時需要大量的士兵，服役時間過長，且沒有繳獲和賞賜，這些特征都是和府兵製矛盾的。所以在唐朝中期之後，府兵製就崩潰了，代替為募兵製。

    本朝的衛所製並不是首創，起源於元朝的衛所製，元朝以搶掠起家，所以讓漢人以半奴隸的方式進行屯田，便於迅速恢複生產和滿足蒙古貴族的享樂。當洪武帝驅除元兵後，獲得了大量的衛所土地，並且長期戰亂，地廣人稀，所以大軍占領土地之後，往往讓軍隊就地屯田，建立衛所。在邊疆更是如此，所以衛所遍布大明。在洪武二十六年，內外衛三百二十九個，按編製每個衛所為5600人，全國衛所兵為一百五十萬左右，平均每個衛所兵年俸十八石左右，所以全國軍隊俸祿共需要2700萬石。而同年夏稅、秋稅的數量在白米2500萬石、麥子470萬石、絹28.8萬匹。目前衛所兵的俸祿基本能夠自給，少量靠地方補助，但是一旦衛所出現問題，龐大的軍餉會耗盡國家的歲入。

    衛所製本身來說，要強於府兵製，首先也沒有擁兵自重之患，其次對於邊疆地區的控製要強於唐朝，但是由於士兵負擔較重，所以逃兵甚多，衛所屯田的產出必然會不穩定。而且衛所是世襲的，世襲這東西其實是很不靠譜的，老子能打仗，兒子未必能打仗，所以衛所的戰鬥力必然是逐步下降的。而且這個衛所世襲讓朱允炆想起了土司的農奴製，軍隊是一個上下級森嚴的組織，如果士兵隨時隨地受軍官控製，那麽和奴隸有什麽區別呢？想到這裏，朱允炆不由得打了一個寒顫，衛所恐怕就是因為這個原因崩潰的吧。

    朱允炆合上兵部的奏折，覺得衛所是必然要改革的，衛所鑄就了大明的輝煌，在人口稀少的情況下，完成了帝國的統一和戰後的重建，但是隨著社會的發展和吏治的腐敗，必然會出現問題，自己需要做的是逐步進行，首先改善軍戶的生活，然後逐步廢除衛所。但是在這個時候做這個是不太適合的，得解決了朱棣才行。

    朱允炆還想起了一個問題，軍戶製相對降低了士兵的自主權，軍官的權力相對增加了，這會導致士兵的逃亡和奴隸化，還會導致軍官的腐化和墮落，所以在明朝後期，軍官的素質迅速下降，被文官瞧不起，並玩弄於鼓掌之間。