洪秀全派陳玉成將北王韋昌輝的人頭送到了安徽。韋昌輝的首級被放在鹽箱裏，飛馬解遞到蕪湖附近某村的翼王駐地，洪秀全還邀請翼王石達開回天京。

    陳玉成對翼王石達開說“翼王殿下，如今大仇得報，天國上下民心所歸，都在翼王。諸將獨服翼王謀略甚深。你若不回，天京必亂！”

    石達開檢驗了韋昌輝的人頭，是真的。但他臉上並無悅色，他對洪秀全的誠意有多少並無把握，便對陳玉成說“小兄弟，伴君如伴虎，眼前的人頭就是例子。我們都小看了天王。在這場天國浩劫之中，天王能毫發無損，他完全有能力穩住天京。”

    石達開的判斷是對的。洪秀全完全有能力穩住天京。韋昌輝被五馬分屍後，他的黨羽前後有兩百人被殺。

    沒來得急跑出天京城的陳承容，也被洪秀全下了大獄，押入死牢。

    燕王秦日綱原來奉北王韋昌輝之命，帶著一萬部屬在外追殺翼王石達開，但他察覺到石達開深得太平軍上下的支持，便掉頭去打清軍了。

    北王韋昌輝被天王洪秀全殺了之後，秦日綱如一匹孤狼，帶著隊伍四處遊蕩，他是忠於洪秀全的，但是天京的大屠殺，他都有份，他不確定洪秀全將會怎麽對他。

    一個月後，秦日綱收到了洪秀全的聖旨，召他回京，聖旨中對他支持過韋昌輝隻字沒提，肯定了他的忠心。

    秦日綱接到聖旨，痛哭流涕，對天長嘯三聲“天王英明！”

    於是，秦日綱率部馬不停蹄趕回了天京，在城外，他的部眾被李秀成收編。

    秦日綱進了城，才發現自己被帶去的不是天王府，而是天牢。

    秦日綱預感到自己的下場，反而心情不那麽緊張了，大笑，然後對李秀成說“我要見天王最後一麵！”

    李秀成說“淪落的囚徒，怎麽會有資格見皇上呢？天王不想見你，但給你帶了一句話。”

    “什麽話？”秦日綱連忙問。

    李秀成說“借你的人頭一用。你的家人天王會照顧。”

    聽了這句話，秦日綱不再說話，一直到天牢裏見到陳承容，他們被關在了一起！他大喊自己“冤枉”，要見天王。

    陳承容說“我們聰明一世糊塗一時，小看了天王，沒有什麽冤枉的！”

    就這樣，秦日綱也被天王詔旨召回天京和同謀的陳承珞一起被處斬。

    天京內訌曆時兩個月，最後，洪秀全及其家族成了最大受益者，他們成為太平天國最高的實際統治者，拜上帝教的絕對權威。

    但是，楊秀清和韋昌輝的死，讓天國上下人心改變，政事不一，各有一心，天父天兄的死，所照成的信仰危機，引起了政治、軍事危機的連鎖反應。

    內憂外患，親自處理朝政時，洪秀全燋頭爛額，他很懷念以前享樂的生活。洪秀全將燕王秦日綱和左天侯陳承容的人頭也送到了石達開的營帳，再次邀請石達開回天京，並表示隻要石達開回去，就改封“義王”。

    當時社會的人，非常注重“義”字，它是維係農耕社會人際第一道德要素。因而尊稱“義王”，是比東王更尊敬的稱謂。石達開見洪秀全殺了天王最信任的秦日綱，還要封他做義王，被洪秀全的誠意感動，決定再給洪秀全一次機會。

    1856年11下旬，石達開由安徽寧國回到天京。他以天國安危、大局為重，不再誅殺任何一個有悖與他的異己分子。

    當石達開風塵仆仆來到天王府議事大廳時，在那兒聚集的部將陳玉成、李秀成等人，和朝臣把石達開環繞起來，對他寄以很大的希望，尊稱他為“義王”。他們同舉石達開提理政務，輔佐天王主持朝政，總理軍國大事。

    但石達開在天國有這麽高的威望，這是他洪秀全未能料到的，也是為他不高興的。洪秀全沒有兌現自己的諾言，沒有馬上封石達開為義王。

    洪秀全囿於群臣推舉，才同意改封石達開為“義王”。石達開見狀，怕自己步了東王後塵，堅持不接受“義王”，仍稱翼王。

    洪秀全也不再堅持，反而要將軍權抓在手裏，宣布自兼軍師，所謂“主是朕做，軍師也是聯做”，集決策和行政大權於一身。

    但石達開在天京，以自己的行為，安定人心，逐漸淡化和消除天京內訌帶來的負麵因素。太平天國是馬上爭天下的，在無日不戰的大江南北幾個戰場，石達開又以高明的以守為攻的戰略方針，重振軍威，強化了拱衛天京的句容、溧水和鎮江等衛星城鎮的防禦，特別是積極支持陳玉成、李秀成在兩淮團結、聯絡十萬撚軍主力部隊，使他們接受太平天國領導和封爵，聯合作戰。

    石達開的聲望日漸超過了天王洪秀全。洪秀全又寢食難安了，畢竟石達開全家被屠殺，洪秀全是有責任的。洪秀全便以他從古史中所學到的帝王學權術，開始挖石達開的牆角。

    洪秀全在天國中樞的天王府，增設了掌率，並取消了六官二十四個正副丞相，改為天王府主持吏戶禮兵刑工等六部的六個侯爵級丞相，他把親信盡量超擢，放在這些重要位置上，如正掌率是弄臣蒙得恩，副掌率是天王的姐夫鍾芳禮。

    洪秀全還封兩兄為王。他封長兄洪仁發為安王，次兄洪仁達為福王，讓他們參政議軍，和石達開並起並坐，但洪氏兄弟是朝野以至敵國皆知的庸才。他們隻是天王的影子，抑製石達開，常與他抬杠、推橫車。

    石達開在天京的日子又日漸難過。石達開部屬張遂謀建議他說“翼王殿下，為了天國，我們再一次清君側吧，誅殺洪氏兄弟，如屠兩狗。”

    石達開搖搖頭，說“不行，一言不合就殺人，那樣我跟韋昌輝有什麽區別？”

    張遂謀問道“那麽我們該怎麽辦，這樣下去，我們不殺他們，他們也會殺我們。”

    石達開歎了一口氣，說“合則留，不合則去。”

    石達開選擇了離開天京，他借口赴南門外雨花台太平軍駐地“講道理”，就與曾錦謙、張遂謀等人離開了天京，經銅井鎮渡江，取道無為州往安慶，沿途遍貼告示

    為瀝剖血陳，諄諭眾軍民。

    自愧無才智，天恩愧荷深。

    惟矢忠真誌，區區一片心，

    上可對皇天，下可質世人。

    去歲遭禍亂，狼狽趕回京，

    自謂此愚衷，定蒙聖鑒明

    乃事有不然，詔旨降頻仍，

    重重生疑忌，一筆難盡陳。

    疑多將圖害，百喙難分清。

    惟是用奮勉，出師再表真，

    力酬上帝德，勉報主恩仁。

    惟期成功後，予誌複歸林。

    為此行諄諭，諄諭眾軍民。

    依然守本分，各自立功名。

    或隨本主將，亦一樣立勳。

    一統太平日，各邀天恩榮。

    洪秀全有石達開，不安，石達開跑了，他也不安。朝野還多有議論，他的兩位老兄成事不足，敗事有餘。遠在淮南戰場的李秀成也甘冒不大韙上表，要求黜安王、福王爵，再啟用翼王。而各路清軍，尤其是江南大營在石達開離京後卷土重來，先後攻陷了溧水、句容，圍困了鎮江。天京內外交困。

    洪秀全不得不聽取眾見，削去兩位兄長的爵位，將爵號另設新爵，即六爵的天安、天福。並鐫刻義王金牌一道及天京朝臣聯合簽名的求救表送往安慶，請石達開回京主政。石達開不接受封爵義王，也不表示回京。在楊秀清被殺後，他已兩次奉天王旨進京的，但兩次卻又都是逃出來的，前車之鑒，風浪險惡，他是再也不願第三次進京，和洪秀全合作了。

    石達開留在安慶五個月，招聚安徽和天京的各路人馬，他帶走的人從四五千變成了四五萬。

    羽翼漸豐，石達開準備攻下江西，以江西為根據地，拿下安徽，然後西進四川，自立為王。而在江西，他最大的敵人就是曾國藩的數萬湘軍。

    曾國藩的用兵戰略，是分三步走，先攻下江西九江，再拿下安徽安慶，接著順江而下，拿下天京！