武將們的意思是立即準備起來，等待時機，隻要能夠掌握蒙古人的確切動向，就可以組織大軍進剿，但是這點遭到了內閣輔臣和文官們反對，他們認為大明主要還是依托邊牆進行防禦反擊就行了，這是大明官軍最擅長的戰法，一旦官軍大軍輕出塞外，在茫茫草原與蒙古人作戰，一旦失利，不但損兵折將，還會折損國威。
    朱載坖對此則是支持了武將們建議，官軍不能被動等待土蠻，必須要主動出擊，否則朱載坖整軍經武，編練新軍的目的何在？就是要揚大明國威，將這些蠻夷打服，守在邊牆算什麽本事，朱載坖就是主動出擊，鍛煉朝廷訓練的新軍，不僅是薊鎮的新軍要參戰，京營、親軍諸衛、禦馬監也都要參戰，加以曆練。
    遠出草原作戰，又是大軍出征，這已經是大明近百年未有之事了，此事關乎大明的國威，朱載坖的個人威望，是隻許勝不許敗的事情，朱載坖對此是很清楚的，所以朱載坖也要求在坐的所有參讚軍務大臣就此事發表意見。
    高拱作為首輔和會辦軍務大臣，直接說道：“蘿川侯乃是大明宿將，哈密伯也出身遼東，他們都是老成宿將，應該對此事都是極為了解的，還是請他們兩位來說說吧。”
    朱載坖的意思也是請馬芳和李成梁來說說，尤其是此戰可能會遭到了困難，他們一個是長期和蒙古人交道的大明宿將，另外一個是生長在遼東，熟悉當地地形天候的老將，他們的意見對於朱載坖來說還是很重要的。
    馬芳首先陳述了自己的看法，馬芳認為對土蠻作戰，主要是難題是怎麽找到土蠻部，土蠻和土默特還是有很大的不同，土蠻的遊牧性更強，而且部落更加鬆散，要想找到土蠻部的主力，是大明官軍最主要的難題。
    還有就是大明官軍這次是大軍出征，步騎混編，機動性上肯定是不如蒙古人的，氣候對於官軍的影響是極大的，草原冬季嚴寒、夏季酷熱，這些時候都不適合大軍作戰，而秋季草原上的蚊蟲肆虐，也不利於官軍大軍作戰，所以能夠作戰的窗口是很小的，馬芳認為戰前的情況工作要做的非常細致，最好還是要動用騎兵遠出奔襲，這樣成功率最大。
    而李成梁則是提出了有關遼東氣候的問題，不同於山西等處的相對幹旱，遼東等地相對比較濕潤，尤其是在春季化凍之後，整個草原都會陷入泥濘之中的，對於官軍的後勤來說是極大考驗，這才是最難的事情。
    對於朱載坖來說，馬芳、李成梁提出來的問題確實是亟待解決的，最大的問題就是要抓住土蠻或者兀良哈的主力，對於蒙古來說，最好的辦法就是逮住蒙古的主力，狠狠的殺傷蒙古的有生力量，這樣才能打痛蒙古，使他們不敢再窺視中原。
    朱載坖要求練兵軍務處立即擬定相關的措施，做好對土蠻和兀良哈用兵的準備。
    經過各位參讚軍務大臣的商量之後，以會辦軍務建極殿大學士高拱和幫辦軍務蘿川侯馬芳、英國公張溶、哈密伯李成梁等人具折朱載坖，提出了備戰的方案。
    第一點是糧秣、豆料的籌措，要在三屯營、遵化、廣寧、遼陽等地興建大型的倉庫，用於囤積糧秣、草料和食鹽等大軍出征需要用的物資，同時加強從東南海運糧食，還有從暹羅、緬甸采購糧秣，通過海運直接運輸到天津和遼東。
    第二點就是大軍行動的藥物、軍器的準備，根據馬芳、李成梁等人的建議，大明重點準備防禦蚊蟲叮咬的藥膏、防蚊的紗帽、雄黃等藥物，還有就是防治腹瀉的藥物，根根他們多年行軍用兵的經驗，大軍行進過程中造成非戰鬥減員最多的就是腹瀉和痢疾，這種看起來並不嚴重的疾病往往會造成大量的非戰鬥減員，所以馬芳等人要求準備大量的治療腹瀉、痢疾的藥物，還要準備正常的止血、金創藥物等。
    第三點就是情報偵察，分為兩個部分來進行，對於朵顏三衛中心向大明和近邊的一些小部落，要予以拉攏，在薊遼等處開設馬市，對他們實行計口售糧，允許他們用馬匹、情報等向大明交換他們所必須的各種物資，從他們的口中打聽土蠻和朵顏三衛的具體情形。當然大明也要派遣尖哨、夜不收等前出哨探，查探相關的情報。
    朱載坖對於這三點都予以準允，發轉薊遼總督譚綸和提督薊遼大寧軍務戚繼光，要求他們造此辦理，所需經費具奏擬來，同時朱載坖下令從暹羅等處收購大米的總量從每年三十萬石增加到一百萬石，責成中南總督殷正茂與各國商量此事。
    譚綸、戚繼光等人收到奏疏之後，很快向朱載坖回奏，闡述了他們兩人對於土蠻和朵顏三衛的看法，現在朵顏三衛中最敵視大明的就是董狐狸和長禿兩人了，因為他們的父親影克為大明所擒殺，他們心心念念的就是為父報仇，而這幾年他們擴張勢力，現在兩人的麾下已經有三萬餘騎了，要是再和土蠻部聯手的話，那就能夠輕易聚集起五萬騎，這對大明來說是一個不小的威脅。
    所以譚綸和戚繼光認為，與其等待董狐狸和長禿聚集兵馬進犯大明，不如主動出擊，在探知兩部的位置之後，率大軍征討。
    朱載坖同意了他們兩人的計劃，要求他們想辦法確定兩部的位置，在製定周密計劃，上奏朱載坖之後，準備對他們兩部進行打擊。
    在朱載坖的支持下，練兵軍務處開始辦公了，朱載坖賦予練兵軍務處的第一個重要的差事就是對禦馬監禁兵、京營、親軍諸衛、薊鎮、遼東鎮、宣府鎮官軍的訓練和裝備水平進行檢查測試，同時核查各地的軍儲是否充實，戰馬是否足數，軍器彈藥是否充足。
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