不過把漢那吉並沒有參與進三娘子對黃台吉的征討，把漢那吉借口自己的部落這次損傷嚴重，要休養生息，所以不參加征討黃台吉的事情了。
    對於把漢那吉的態度，三娘子不以為意，現在他已經完全坐穩了位置，整個土默特部誰敢和他抗衡，現在就是要斬草除根才是。
    而三娘子的這種行為，當然引起了大明的警惕，三娘子所表現出來的強勢令大明的重臣們感到不安，大明好不容易才盼到俺答死了，找到機會重創土默特部，可以使得大明的九邊能夠消停一陣子，三娘子這樣大規模的征討顯然是不合大明的利益的。
    朱載坖當即召集閣部重臣商議此事，對於三娘子的行為，重臣們都認為她有點飄了，不予以震懾，恐怕她不明白大明是幹什麽吃的。
    對於大明來說，一個強大的土默特部並不是大明所希望看到的，這點朱載坖君臣都很清楚，之前朱載坖就此事已經和閣部重臣還有參讚軍務大臣們商量過了，黃台吉現在已經喪失了爭奪土默特大汗的能力，若是他能夠歸順大明，為大明邊牆外的藩籬，大明可以居中調節，保他一條狗命。
    主要是用黃台吉來製衡三娘子，免得三娘子的勢力膨脹的太快了，同時對於三娘子也要加以震懾。所以朱載坖下詔，總督薊遼大寧等處兵部尚書譚綸和提督薊遼大明軍務事曹國公李庭竹，整頓三鎮兵馬，尤其是薊鎮，要整肅兵馬，以備不測，同時向邊外派出哨騎，查探相關的情況。
    同時薊遼和禮部要嚐試招撫黃台吉，要是黃台吉願意向大明歸順投效，大明願意居中調停此事，保他一條狗命，要是黃台吉仍舊桀驁不馴的話，不用三娘子動手，大明就要和黃台吉新賬老賬一塊算了，不僅如此，朱載坖也命令兵部與宣大、薊遼各鎮商量，參照洪武年間的邊鎮建製，以恢複當年的邊防，重新在大明的北方，構建起一套防禦體係。
    對於此事，朱載坖是極為重視的，關乎著大明未來的邊防要事，朱載坖明確指示練兵軍務處和兵部、五軍都督府，要構建攻守兼備的邊防體係，不僅僅要考慮防禦，更要考慮主動出擊，朱載坖給練兵軍務處的指示是立足於防，著眼於攻，守固便攻，攻防兼備。
    在具體的選址上，要依托山川險隘構建東西呼應的外圍防線，重視邊防的層次性，設置縱深防禦帶，整體與局部相結合的防禦機製，尤其是要利用各處的地形，構建起一整套完備的北部邊疆防線。
    朱載坖認為，防線的構建必須具備一定的條件，除了屯聚重兵，擁有強大的防禦兵力，還必須具備地理優勢，控扼山川險隘。大明的邊防線極為漫長，東起遼東，西至西域，綿延萬裏，要構建有效防線難度極大。
    所以必須控製一些要害之所在，然後將其串聯成串，組成大明最外圍的邊防線，要充分利用山川等自然之險，占據較為有利的地形，朱載坖著重指出了幾個地方，寧夏後倚黃河，前屏賀蘭山；東勝外有狼山、陰山，內有黃河；大同西北矗立大青山；宣府山川糾紛，地險而狹；大寧山勢連亙千裏，山外撤江環繞。
    不僅僅是占領這些地形險要的戰略要點，還要相互溝通，形成聲勢相依的防禦體係，在東西連通的要點如大寧、開 平、宣府、大同、東勝、寧夏等地都要設置重兵。同時興修一係列的邊堡和各種工事、道路等，用以互相溝通，以點串線，以線構麵，形成嚴密的邊防體係。
    具體到現在的大明北部邊防，朱載坖也親自提出了要求，如大寧鎮，其地繞出山後，與薊鎮、遼東、宣府、大同勢相連屬，要大修道路，與相鄰的各鎮互相呼應，加強各鎮的協同作戰能力，修築道路和各種邊堡。
    而對於開平衛，則是要發揮他在草原上的眼睛的作用，開平衛是大明安插在草原上的眼睛，是大明用以偵察草原動向的重要據點，也是大明討伐北虜的重要攻擊出發陣地，所以對於開平衛來說，要和附近的各鎮建立緊密的聯係，在開平衛東西設置八個重要的邊堡和兵站，東則涼亭、沈河、賽峰、黃厓，接於大寧古北；西則桓州、威虜、明安、隰寧，接於獨石，將大寧、宣府兩鎮通過開平衛連接起來，使得開平衛成為大明北部邊疆的重要防禦支點。
    在大同與東勝之間，要設有衛所相連，聲息互通。東勝則是溝通北部與西北部聯係的要地，以東勝衛聯係大同和寧夏，這樣的話，從遼東至寧夏、甘肅，彼此相望，首尾呼應，要力求達到一處有警，多處聲援的效果。
    除此之外，還有構建縱深防禦，增加防禦的韌性和強度，大明的邊防形勢錯綜複雜，拒敵於國門之外固然是理想的防禦模式，但朱載坖很清楚，世上沒有突不破的防線，一旦突破大明的防線，北虜就會接近大明的腹地，所以大明必須要構建有縱深、多層次的北部邊防體係。
    其實這點在洪武朝所構建的北部邊防體係中有所體現，除了在大寧、開平、東勝等外邊建設邊防體係之中，還要設置內邊，作為大明的最後一道防線，而在外邊和內邊之間，還要選取有利地形，修建邊堡，而內邊的起止，大概就是現在的九邊，自偏頭、雁門、紫荊、曆居庸、湖河川、喜峰口，直至山海關一帶，延袤數千餘裏。山勢高險，林木茂密，人馬不通，實為第二藩籬。
    朱載坖命令在這些地方也要增修邊堡，同時還要配置預備隊，修設險隘，嚴加戍守，在外邊和內外之間，就是大明的縱深防禦帶，官軍的主要任務就是將北虜拒之於國門之外，如果北虜突破外邊，官軍就要在內邊和外邊之間的縱深防禦帶將入侵的北虜予以殲滅，同時堅守內邊。
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