朱載坖對於朝堂上的這些聲音保持了沉默，這就更使得朝廷上下對於此事議論紛紛，再加上此次所損失的漕糧以二十萬石計，損失確實是十分巨大的，別說朱載坖，就是戶部尚書鄢懋卿、總督倉場戶部尚書王國光等人也斷然不能接受，紛紛上疏要求嚴究此案，務必要將幕後真凶緝拿。
    而朱載坖則是召見了錦衣親軍都指揮使陸繹和提督東廠馮保，詢問他們對於此案的看法，兩個廠衛頭目自然也是認為此案中定有貓膩，但是就連陸繹也不得不承認即便是廠衛，要想查察此案，也是非常之麻煩的，對於廠衛來說，漕幫這樣的組織本來應該是廠衛重點的監控對象，但是實際上，廠衛對於漕幫的了解並不多。
    陸繹說道：“陛下，以臣之經驗，此案中必有貓膩，但是要詳加查察的話，恐怕耗費不少功夫。”
    朱載坖也問道：“這漕幫是何來曆，連廠衛也輕易不能查實？”
    陸繹隻能報之以苦笑，其實漕幫就是脫胎於這些漕運衛所的，由於最開始大明實行的是兌運製，也就是有地方的所謂糧長負責征收漕糧，然後交給運軍運輸，而這些所謂的糧長，都是地方豪強，他們對於運軍是百般欺淩，之前就有官員上疏陳述過此事。
    在官府的記載中，這些糧長對於運軍們百般欺淩：“嘉、湖、蘇、鬆糧數獨甲江南，納戶率皆豪右，甚且親識大姓賄投門下，應兌糧米，顆粒不行進倉，大書告示，逼軍私兌，稍不如意，任憑軍官停船守候，屢謁門牆，經月不兌。有司明知，而 不敢問。夫民既恃勢以淩軍，軍安得不挾眾以虐民，是鼓噪之釁，寧獨啟自運官，實亦不肖有司畏徇強禦，破壞漕規，激使然耳。”
    運軍們也團結起來，對抗這些糧長，也就形成了漕幫的雛形，這些運軍中敢於帶領士卒們和這些糧長對抗的，也就成為了後來漕幫中的所謂好老。
    其實漕幫就是脫胎於漕運衛所之中的，所以漕幫的組織等很有軍隊的特點，組織嚴密，內部紀律嚴格，管理也相對嚴格，在加上廠衛之前也對於漕幫關注的不多，現在猛地要查，確實是比較困難的。
    不過對於漕運的情況，廠衛還是有所了解的，漕幫基本上都是本衛子弟所組成的，所以廠衛探子也確實不容易打入其中，從漕運衛所的角度來看，一衛需要派兌多個府州縣的漕糧，在衛所裏麵則衍生出漕幫派兌多個州縣水次漕糧。從州縣的角度來看，一府由多個漕運衛所兌運漕糧，一縣也可以由多個幫兌運漕糧。
    漕幫和漕運，就是互相依存的關係，現在朱載坖要減少漕運數量，對於這些漕幫來說當然是極為不利的，更不要說朱載坖還準備將這些運軍打散編入各水師之中，這等於變相要解散漕幫，他們當然是不會答應的，所以從作案的動機和作案的能力上來說，漕幫確實是很有可能的。
    朱載坖在召見了廠衛頭目之後，然後召見了刑部尚書洪朝選，詢問他對於此案的看法，洪朝選也認為此案和漕幫脫不了幹係，但是同時也不得不承認，要查察此案，難度是很大的，至少勞堪和張學顏洪朝選是不看好的，洪朝選認為勞堪狠辣有餘，細致不足，張學顏則是惟張居正馬首是瞻，不能做到公正處理此事，他們兩人處理此案，恐怕不能使得朝廷上下心服口服。
    朱載坖當然知道洪朝選和張居正關係不佳，之前兩人因為遼王案就結怨，現在雖然張居正擔任首輔，但是洪朝選也不是什麽軟柿子，一向不怎麽把張居正當回事，朱載坖也直接問道：“那以大司寇之見，當遣何人查察此案呢？”
    洪朝選向朱載坖推薦了南京戶部左侍郎王宗沐，因為他長期在有關漕運的部門任職，熟悉漕運的相關情況，而且辦事穩重，也接觸過漕幫，洪朝選認為他能夠比較公正的處理這個問題。
    朱載坖記下來了之後再次召見首輔張居正，朱載坖說道：“大司寇向朕推薦南戶部左侍郎王宗沐查察此案。首揆怎麽看此事？”
    張居正一聽是洪朝選舉薦的人，心中一下子就警惕起來了，他一向不希望洪朝選，認為他和他的福建老鄉李默一樣過於清高，看不清形勢，當然張居正也清楚，這也是朱載坖的帝王心術，現在處理此案的勞堪和張學顏都是張居正舉薦的人，當然也要派遣一些不是張居正派係的官員去處理此案才行，否則萬一他們聯手糊弄朱載坖這個皇帝怎麽辦？
    所以對於朱載坖準備派王宗沐赴淮安查察本案，張居正也是同意，同時張居正也向朱載坖舉薦工部尚書總督河道潘季馴查察本案，對於張居正的舉薦朱載坖也予以接受。
    對於台諫的上疏，朱載坖一律留中不發，隨後下達詔書，升南戶部左侍郎王宗沐為南刑部尚書，與工部尚書總督河道潘季馴、錦衣中衛指揮僉事劉守有、內官少監陳矩一道，以欽差查察本案。
    朱載坖同時再次下達命令，以今年漕渠事故頻發，漕糧損失嚴重為由，直接暫停了今年的運河運輸，命令東海水師和北洋水師一道，雇傭地方海船，協助朝廷轉運漕糧和秋糧。
    朱載坖的詔令下達之後，滿朝一片嘩然，原本大家都很清楚，這些運河上發生的事故，是反對河海兼運的這些勢力製造出來的，借以給朝廷施加壓力的，沒想到朱載坖直接下令暫停河運，這不是更加刺激這些人嗎？
    很多官員都向朱載坖上疏，認為不宜過於激進，畢竟事緩則圓嘛。但是這些奏疏都被朱載坖留中不發了，同時總督倉場戶部尚書王國光向朱載坖上疏，請求對於水次倉和沿運河的倉庫予以清查，查察其中的情弊。
    在張居正的支持下，朱載坖同意了王國光的上疏，遣王國光為欽差，持節賜天子劍在親軍諸衛的護送下清查各水次倉。
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