第三十八章 忙忙碌碌
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最新網址:.. 他使用了一款叫做“string”的工具,這是一種常用於基因相互作用網絡分析的數據庫,它可以幫助研究人員找出基因之間的相互作用。
隨著陳飛的操作,一個複雜的基因網絡圖逐漸出現在屏幕上。
那些差異表達顯著的基因位於網絡的中心,周圍則是與它們相關的其他基因。陳飛的目光在網絡中遊走,尋找那些與癌症密切相關的基因。
發現關鍵基因:tp53
陳飛的眼睛亮了起來,網絡的中心有一個熟悉的基因:tp53。
這個基因被稱為“基因組的守護者”,它是人體內最重要的抑癌基因之一。當tp53發生突變時,細胞就會失去抑製癌變的能力,從而導致腫瘤的形成。
“沒錯,tp53果然是肝細胞癌的關鍵。”陳飛自言自語道,“它的突變可能是推動癌症發展的主要原因之一。”
他將tp53作為核心節點,進一步分析了它的下遊調控基因。
通過這次分析,陳飛得出了一個完整的基因調控網絡圖,展示了tp53在肝細胞癌中的作用,以及它如何通過調控其他基因,推動癌症的發展。
第五步:驗證和發表文章
實驗思路逐漸成型,接下來就是如何把這個思路撰寫成文章並發表。
陳飛深知,任何實驗都需要通過驗證和同行評議,才能被科學界接受。
他決定將這篇文章的核心思路和實驗結果匯總,寫一篇論文。
文章會詳細描述如何通過rnaseq數據、隨機化采樣、差異表達基因分析以及基因調控網絡的構建,找出肝細胞癌的關鍵基因,並將tp53突變作為核心推論提出。
“這篇文章,一定能成功。”他笑著對自己說道。
夜已深,陳飛依舊伏案工作。rna、肝細胞癌、tp53……這些關鍵詞不斷在他的腦海中閃現。此刻,他仿佛回到了孟德爾那個時代——一個科學家在默默無聞中堅持著自己的研究,等待著真理的閃耀。
“孟德爾,你能成功,我也能。”
陳飛喃喃自語,然後繼續敲打著鍵盤。
這一次,屬於陳飛的科學篇章,正悄然展開。
陳飛坐在電腦前,眼睛盯著屏幕上的代碼,雙手飛速地敲擊鍵盤。
他知道,係統給出的實驗思路是他的機會,作為一名本科生,能參與到高水平的生物信息學研究中已經是件不容易的事。而他更明白,要想從中脫穎而出,除了跟隨係統的提示,還必須掌握更多的技能,比如——編程。
是的,自學代碼,這是他目前最迫切的任務。
“寫代碼居然比搞實驗還痛苦……”
他歎了口氣,揉了揉發酸的眼睛,但隨即又集中注意力,繼續學習。他現在使用的是python語言,專門用於處理rnaseq數據的生物信息學工具包。
複雜的基因網絡分析、差異表達基因的篩選,都要通過這段段枯燥的代碼來實現。
時間悄然流逝,大三下學期的四月已經悄然到來。
四月,對很多人來說是充滿生機的季節,但對陳飛來說,這更像是一場馬拉鬆的中段,他既要麵對學業的壓力,又要抓緊準備各大高校的夏令營。
夏令營,這不僅僅是一個鍛煉機會,更是提前鎖定保研名額的最佳途徑。各大高校的夏令營競爭激烈,機會稍縱即逝。他需要為自己爭取一個席位,但眼下最緊迫的,是將係統任務的文章投出去。
陳飛的宿舍已經變成了他的臨時“實驗室”。
書桌上堆滿了參考書、筆記本,旁邊還有一杯早就冷掉的咖啡。每當同學們經過他的桌子時,都會不自覺地停下腳步,驚歎於他那專注的神情。
“飛哥,這都大三了,你還這麽拚?別卷了別卷了,快來打遊戲!小哥哥小哥哥,快來玩呀!”同寢的室友小王一臉揶揄地看著他。
陳飛頭也不抬地敲打著鍵盤,淡淡地回了一句:“拚一下,不然以後就得洗碗了。”
雖然話說得輕鬆,但他心裏清楚,這篇文章意味著什麽。
作為一名生物信息學的“新手”,他必須比其他人更加努力,才能在這個領域站穩腳跟。而且,他投的期刊可是atics,影響因子高達9分!
這可是難度極高的期刊,隻有頂尖的研究才有機會在這裏發表。
隨著時間推移,一陣清脆但致命的鬧鍾聲從手機傳來,陳飛從電腦前匆匆站起身,拿起實驗服,快速趕往實驗室。
鼠房,那是他的另一片戰場。在這裏,他需要對數以千計的實驗老鼠進行管理和處理。小小的鼠房彌漫著特有的氣味,吱吱作響的老鼠籠子擠滿了每一個角落。
每次進入鼠房,陳飛都會先深吸一口氣,仿佛要在這片“鼠海”中打起一場艱難的戰鬥。
陳飛不由得想起來自己第一天進入鼠房的那次經曆。
陳飛第一次走進實驗大樓的那天,正好趕上了“鼠房”當班。
他當時心裏充滿了好奇和期待,畢竟對於一個剛剛走進大學的本科生來說,此時的實驗室裏還是充滿各種神秘的故事。
可是,等他被帶到更衣室,師兄一臉嚴肅地對他說:“先洗澡洗頭,換上這套衣服。”他愣了一下。
“洗澡?”陳飛看著師兄遞過來的一大堆物品,有毛巾、洗發水、浴巾,還有一套看起來像桑拿服的粉色衣服,腦子裏冒出了一連串問號。
他下意識地以為,或許實驗室有些“人性化”,在處理完老鼠之後能泡個澡放鬆一下,順便消消毒。這念頭一冒出來,他甚至有點小興奮,心想科學研究果然講究高規格。
可等他一頭紮進浴室,沒泡著澡,還得認真洗幹淨自己,再一出來,見到那看起來像是去桑拿房穿的鬆鬆垮垮的衣服時,他並沒有意識到,這不是休閑放鬆的預兆,而是噩夢的開始。
他按照要求把自己清洗得像個瓷娃娃似的,頭發也得洗得幹幹淨淨,剛換上那套寬鬆的桑拿服,準備問師兄接下來是不是該去“休息”了。
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