結束住院生活後的鳴瀨玲人，在缺席許久的班級中發現了不認識的少女朝槻憐。原本以為她是轉學生，但班上同學卻都說她很久以前就存在了。對同學在接觸到憐的謎團時會陷入昏迷感到困惑的玲人，在與憐獨處時查覺到強烈的不協調感。她是和名為「時之意誌」的巨大存在有關聯的人物―― 連自殺都死不了的悲觀少女，與無可救藥般樂觀的少年，兩人編織出希望的故事。