十八世紀，神秘的巨大生物<蟲>瞬間席卷全世界。 巨大的怪異生物造成的巨大災害，以及災害過後轉變而成的化石燃料，令世界發生了翻天覆地的改變——。 故事發生在原本被稱作「明治」的時代的不久之前。在前往異國的航道上，少年·秋津慧太郎遭遇一夥操縱蟲的男人的襲擊，漂流到了某海岸。然後，他的左眼得到了神奇的力量。漂泊到荒野上的慧太郎，遇到了愛著蟲，並以研究和處理蟲為生業的美少女亨利·法布爾。 又一個綻放在近代，點綴著蒸汽、蟲、與戀愛的幻想故事開幕！