二〇××年，散落於某國遼闊原野的某個石窟裏，發現了大量的羊皮紙。發現者是聞名世界的女性考古學家早苗‧Ｒ‧上島博士。根據她長年以來研究這片土地曆史的結果，她深信這一帶在史前時代就有發達的文明與人類生活的痕跡。調查過挖掘出來的遺物後，得知這些遺留下來的文明，對人類來說是未知的領域。神又是什麼樣的一種存在？在遙遠的過去，這片土地上曾經有茂密的森林、湧泉、河川，還有人類居住的城市，處處都有神的影子。神到底如何成為神？人與神如何共生？神又是什麼樣的一種存在？上島博士看著從未見過的文字，小聲嘟嚷道。……「留伊。」……