對於東南的一係列改革安排下去之後，朱載坖考慮去北直隸、河南等地看看，畢竟大明這麽大，朱載坖也想去看看，尤其是之前在北直隸推行大規模的水利興建，到底的成效如何，北直隸的工農業情況現在到底是個什麽樣子，朱載坖準備實地去看看成果如何。
    對於朱載坖的想法，首輔張居正倒是並沒有表示反對，朝廷現在重點經略北直隸，朱載坖作為皇帝，親自去查看一下，也不是不可以的，不過張居正建議朱載坖還是緩一緩再去，把朝廷先安定下來，同時將一應改革的措施落地之後再說。
    而且現在中南總督殷正茂的一份奏疏也不得不引起朱載坖的重視，殷正茂說的西南的土司問題，之前四川的都掌蠻叛亂，雖然被譚綸給鎮壓了，但是西南地區的土司問題依舊是十分嚴峻的，殷正茂向朱載坖這次提出來的是貴州的楊應龍，殷正茂認為這孫子不是個好鳥，宜早除之，同時對於這些土司，大明也要采取更加嚴厲的方法駕馭管束。
    殷正茂認為，這樣楊應龍絕非安分之輩，生性猜疑、陰狠嗜殺，居所雕龍飾鳳，又擅用閹宦，儼然是一個土皇帝。楊應龍為人狡詐多疑，好以誅殺立威，結怨甚深，所轄五司七姓不堪其虐，紛紛叛離。對於此人，殷正茂認為應當及早除之，以絕後患，同時對於這些土司，逐步予以清除，由朝廷改派流官對地方進行管理。
    對於殷正茂的上疏，朱載坖沒有第一時間作出回應，雖然他知道殷正茂的判斷是正確的，這個楊應龍確實不是什麽善類，但是朱載坖仍舊將殷正茂的奏疏先下閣部商議，殷正茂是張居正的同科和死黨，張居正自然是支持殷正茂的判斷的，不過張居正仍舊堅持不用兵的看法，張居正認為能夠隻誅首惡的話，是最好的。
    兵部尚書汪道昆也支持殷正茂的看法，汪道昆在兵部的奏疏中認為由於之前朝廷對於緬甸的大舉征伐，同時為了維持在緬甸的軍事存在，朝廷從四川、雲南、貴州等地大量抽調士卒前往緬甸，導致四川都司等地空虛，所以西南的很多土司蠢蠢欲動，楊氏曆代統治播州，勢力盤根錯節，早有不臣之心，他認為四川官軍弱不經戰，非常輕視，久欲占據整個四川，獨霸一方，殷正茂的上疏確實是非常有道理，宜早用兵，以免到時候流毒太甚。
    但是戶部尚書鄢懋卿等人則是認為現在談用兵，未免過早了，朝廷現在推動一條鞭法和攤丁入畝的改革，需要一個相對穩定的國內環境，這個時候應該以保持穩定為主，為朝廷的各項改革提供一個穩定的國內環境，所以應當盡量避免用兵，畢竟楊應龍現在沒有明確的謀反，朝廷隻要不刺激他，短時間內應當是不會出什麽事的。
    而科道則是借機彈劾殷正茂，認為他好大喜功，輕啟邊釁，同時還彈劾他貪婪等罪狀，不過這些都被朱載坖留中不發了，朱載坖確實知道殷正茂生活奢靡的事情，但是朱載坖認為緬甸等要地，非殷正茂不能鎮守，而且殷正茂還是有分寸的，這麽多年以來都能夠保證緬甸的穩定，不斷增加大明在緬甸的移民，控製了整個伊洛瓦底江沿岸，開墾了大量的土地，為朝廷穩定了西南，所以朱載坖對於殷正茂一向都是保護的。
    對於殷正茂的奏疏，閣部意見不一，朱載坖於是召集閣部重臣們，商量此事，朱載坖首先問道：“諸卿以為，殷正茂所奏楊應龍不軌，是否屬實？”
    其實大家對於這點基本上都是同意的，說個不好聽的，這些土司們有一個算一個，都是心懷不軌的潛在逆賊，所謂土司都是在一些邊陲之後，占據險要地勢，朝廷不好控製，所以才實行土司製度，其實就是朝野對無力顧及的西南邊陲地區土人頭目的一種籠絡手段，所謂以土官治土民，承認各少數民族的首領世襲地位，給予其官職頭銜，以進行間接統治，朝廷的政令實際上並沒有能夠得到真正的貫徹。
    在土司統治下，土地和人民都歸土司世襲所有，土司各自形成一個個勢力範圍，司法、財政、行政、兵事都可以自治，對於當地人民予求予取，掌握一切生殺大權，除了不能登基稱帝，其他一切甚至比照皇帝，而且隻需要象征性的向朝廷繳納微薄的賦稅。
    所以說其實在朝廷重臣們的眼中，所有的土司都是潛在的逆賊。
    首輔張居正就說道：“陛下，此輩必假我爵祿，寵之以名號，乃易為統攝，故奔走唯命，若朝廷征調頻繁，則急而生變，恃功怙過，侵擾益深，其中陰蓄不軌者甚多。”
    張居正說的確實是現在的現實情況，從大明立國以來，西南土司的叛亂就沒有停息過，尤其是廣西的瑤族叛亂，堪稱大明永不落幕的史詩，即便是經過從王守仁、張經、殷正茂等幾代督撫能臣的討伐，也隻能說暫時穩定了局麵，這些土司確實是極易反叛的。
    兵部尚書汪道昆也說道：“陛下，彼輩狼子野心，專橫不法，目前雖無大害，日久將為隱憂。”
    這點朱載坖也是讚同的，現在看起來這些土司能夠和朝廷和睦共處，但是一旦朝廷大規模的開發西南的，必然和這些土司們發生衝突，他們肯定會與朝廷爭奪土地、礦藏等資源，阻撓驛路通行與外來人口進入，這是朱載坖決不能容忍的，而且朱載坖一直也有改土歸流的想法，之前隻不過是沒有來得及處理罷了，現在殷正茂既然提出此事，朱載坖就要慎重對待了。
    朱載坖於是問道：“卿等以為應該如何處理楊應龍之事？”
    當然，現在的緊迫之事是怎麽解決楊應龍的事情，是否要處理，是否要用兵，這是現在朝廷分歧比較大的問題。
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