後來由於朝廷實施宗祿永額，和一係列打擊宗室的舉動之後，使得楚藩的財政情況更加拮據，其實現在各個宗藩財政都比較拮據，但是其他的宗藩並沒有出現這樣的事情，唯獨楚藩出現這樣的事情，肯定還是有他自己的原因的。
    對於朱載坖的這個看法，張居正也認為確實如此，楚藩現在的亂局，和嘉隆年間在位的端王、湣王和恭王三人還是有很大的關係，這三位首先就不是什麽好鳥，在處理宗藩關係上，楚王自己就做不到在宗藩內部處事公允，端王和湣王還經常包庇依附於自己的郡王、將軍等宗室，打壓和侵克反對他的宗室，因此導致宗室離心。
    而楚藩內部還出了弑父這樣的醜聞，使得楚王的威信更是大幅度降低，宗藩內部對於楚藩的敬畏之心已經完全喪失了，為了爭權奪利而互相攻訐是非常正常的事情。
    至於此案具體應該怎麽處理，內閣輔臣們也是看法不一，陳以勤就認為，楚藩是大藩，武昌郡中闔府之諸宗不下三四千位，又是太祖親封之藩，處理還是要慎重一些，以保全宗室的顏麵也主要目的。
    不過次輔張四維則是揣摩了朱載坖的心意之後說道：“陛下，楚藩人數眾多，雖多良善，實繁凶暴，宜以國法繩之。”
    張四維的話確實很得朱載坖的心意，對於楚藩，朱載坖實在是沒有任何耐心了，嘉靖年間的那些爛事朱載坖不想去再談了，但是從朱載坖即位以來，楚藩是沒少給朱載坖整活，隆慶五年，楚恭王死，由於繼任楚王還在強暴之中，所以朝廷命令武岡王朱顯槐暫攝楚藩。
    沒想到上來就給朱載坖整個大活，誘淫王妃杭氏，並盜楚庫無遺，被楚藩宗室揭發，朱載坖還沒來的及處理他，這廝竟然甚至借恭王長女生辰之機，帶藥謀害華奎、華壁， 因被發現及時未成功，被儀賓劉宗源、謝士光等上京具奏，事下都察院查勘，簡直是耗子腰裏別了杆槍，起了打貓心思。
    朱載坖當然不能容忍，將其圈禁起來，由其子繼承武岡王爵位，然後由朝廷指令東安王暫攝楚府，但不許收掌本府錢糧，隻住門外空宅以遠嫌疑，但是沒想到也能整出事情來，隆慶十年，東安王與楚王實則是太妃和楚王府宦官因為爭奪一所宅院而爆發激烈的衝突。
    楚王向朝廷上疏，言東安王用事群奸，侵克錢糧，叢計撥置，各宗儀不遵約束，朋黨抗違。東安王也彈劾王府內侍侵占王府錢糧，搞得朝廷也極不耐煩，再次將東安王的攝府事解除，以武岡王攝府事，這次武岡王不願惹事，隻是掛個名頭，根本不管王府的爛事。
    這就導致現在的楚王府實際上是太妃和一眾內臣在管事，他們千方百計的想增加楚王府的收入，但是現在朝廷對各宗藩的態度是很明確，之前的奏討祈請是顯然不可能的，為了撈錢，他們將主意打到了宗室身上，克扣郡王、將軍們的宗祿，導致楚府宗室和楚王的矛盾極深，再加上現任楚王的身份確實存疑，在矛盾激化之後，楚藩宗室選擇憤而反擊，揭發此事，也就不足為奇了。
    本質來說，就是楚藩的內訌，但是問題是朝廷要如何處理此事，事情已經過去十年之久了，朝廷就是想要再行查勘，恐怕也不是什麽容易的事情。
    所以張居正的看法很明確，這種事情，是無法拿到台麵上來說的，宮闈秘事，誰又說的清楚，朝廷恐怕既不能證明楚王的血脈真實，也很難證明楚王不是朱家血脈，到頭來損的天家的顏麵，所以張居正的想法大張旗鼓的和稀泥，畢竟現在事情已經被捅破了，朝廷不可能毫無反應，否則無法對天下人交代的。
    朝廷肯定是要嚴究此事的，但是是否能夠將此案查清楚，那又是另一回事兒了，反正要先將此事拖過去，等到事情的平息下來之後，朝廷再作處斷，方才是合適的辦法，畢竟事緩則圓嘛。
    朱載坖也同意張居正的看法，先查下去再說，至於最後怎麽處理此案，自有朝廷做主。
    除了楚宗之案外，就是杭州浙兵之事，之前嘉靖年間為了應對倭寇的襲擾，前浙直總督胡宗憲招募士卒，由戚繼光、俞大猷加以訓練，在浙江編練了一支數量相當可觀的軍隊，在抗倭結束之後，總共4.5萬人的浙兵，被編為9個營，駐紮在杭州城永昌門外的羅木營。其中2個營用於守衛杭城，7個營用於防汛，三月出巡，六月汛期結束返回兵營。
    現在承平日久，不少浙江的官員認為再養著這四萬五千大軍，實在是靡費錢糧，所以浙江的官員們上疏請求將之遣散，但是練兵軍務處顯然不同意，戚繼光等大將們認為，浙江乃係朝廷要地，設兵嚴防，本就合宜，若因承平遣散，一旦有事，又何處覓兵勇？
    所以練兵軍務處認為不能裁撤，為此事僵持不下，隻能奏請朱載坖聖裁，朱載坖也認為堅決不能裁撤，這批浙兵士很有戰鬥力，裏麵又不少人都是和倭寇見過血的，還算是東南的勁旅，將其裁撤說不定會搞出事情來，絕對不能這麽幹。
    但是現在浙江確實並不需要這麽多的兵力駐防，朱載坖和內閣商量之後，將這四萬五千人分成三部分，其中兩萬仍留在浙江，補充進浙江鎮和浙江水師中，加強浙江沿海的防禦，一萬人作為班操京軍調入京師，與京營一道操練，一萬五千人增援給徐渭的安東都護府，加強朝廷對於倭國的控製。
    朱載坖同時傳令浙江，不準克扣軍餉，仍留浙江的兩萬是，乃是朝廷的經製之兵，軍餉由朝廷保證，軍餉軍糧，不準隨意克扣，同時要嚴加訓練，嚴防倭寇襲擾和打擊沿海的走私。
    而朝廷派出的欽差也已經在路上，朝廷已經先傳令湖廣的撫按官將涉案人等先控製住，以備朝廷查勘。
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