關羽在回師途中，多次派使者與呂蒙聯係，呂蒙每次都厚待使者，讓他們在城中自由參觀，挨家挨戶問候將士家屬，有的人還托使者帶親筆信回去報平安。使者返回後，關羽部下私下打聽家中情況，得知家人都安然無恙，待遇甚至比平時還好，因此將士們都失去了戰鬥意誌。恰逢孫權隨後趕到南郡，關羽自知孤立無援，就退守麥城，向西逃到漳鄉時，部下將士紛紛叛逃投降。孫權派朱然、潘璋率軍切斷他的去路，最終將關羽父子活捉，荊州從此平定。
    孫權任命呂蒙為南郡太守，封為孱陵侯，（《江表傳》記載孫權在公安舉行慶功大會，呂蒙以病為由推辭封賞，孫權笑著說“活捉關羽的大功，全靠子明謀劃，現在大功告成，慶功賞賜還沒施行，你怎麽能悶悶不樂呢？” 於是增派步兵騎兵和鼓吹樂隊，下令挑選虎威將軍的官屬，連同南郡、廬江二郡的儀仗隊伍都配給呂蒙。授封儀式結束後返回營地時，兵馬前導後隨，沿途鼓吹演奏，榮耀顯赫。）賞賜錢一億、黃金五百斤。呂蒙堅決推辭金錢賞賜，孫權不許。封爵的文書還沒下達，呂蒙的舊病就突然加重。當時孫權在公安，立刻把他接到內殿診治，動用了各種方法救治，招募國內能治好呂蒙病的人，懸賞千金。每當醫生給呂蒙針灸，孫權都為之感到悲痛；想多看看呂蒙的氣色，又怕打擾他休息，就派人在牆上鑿洞偷偷探望，見他能稍微進食就喜形於色，和左右侍從說笑；要是病情沒有好轉就唉聲歎氣，夜不能寐。呂蒙病情稍有起色，孫權就下令赦免罪犯，群臣都來慶賀。後來病情再度惡化，孫權親自到床前探望，還命道士在星空下為他祈禱續命。呂蒙最終在四十二歲時在內殿去世。孫權悲痛萬分，為他減少飲食以示哀悼。呂蒙生前將所得的金銀財寶和賞賜全部交給府庫收藏，囑咐主管官員在他死後全部上交朝廷，喪事務必從簡。孫權得知這些事，更加悲痛感動。
    呂蒙年輕時沒讀過多少書，每次向孫權陳述大事，常常是口述讓別人寫成奏章。他曾因為軍營中的事務被江夏太守蔡遺彈劾，卻毫無怨恨。後來豫章太守顧邵去世，孫權詢問該任用誰接替，呂蒙趁機推薦蔡遺，說他是恪盡職守的好官。孫權笑著說“你這是要做祁奚那樣推薦仇人的君子嗎？” 於是采納了他的建議任用蔡遺。
    甘寧性格粗暴好殺，不僅常常違背呂蒙的心意，還時常違抗孫權的命令。孫權對甘寧很生氣，呂蒙總是勸諫說“天下還沒平定，像甘寧這樣勇猛的戰將很難得，應當容忍他。” 孫權於是厚待甘寧，最終充分發揮了他的作用。
    呂蒙的兒子呂霸繼承爵位，朝廷配給三百戶人家為呂蒙守墓，還免除五十頃田地的賦稅。呂霸去世後，他的哥哥呂琮繼承侯爵。呂琮去世後，弟弟呂睦接著承襲爵位。
    孫權曾經和陸遜評價周瑜、魯肅和呂蒙說“公瑾（周瑜）雄烈過人，膽略超群，打敗曹操，開拓荊州，他的功業高遠難以有人繼承，如今有你繼承他的事業。公瑾從前邀請子敬（魯肅）東來，把他引薦給我，我和子敬宴飲交談，他就談到建立帝王大業的方略，這是第一件讓我痛快的事。後來曹操借著收降劉琮的威勢，揚言要率領幾十萬大軍水陸並進江東。我召集眾將谘詢對策，沒人能先提出合適的主張，直到子布（張昭）、文表（秦鬆）都建議派使者寫檄文投降曹操，子敬當即反駁說不行，勸我趕緊召回公瑾，把軍隊交給公瑾指揮，迎擊曹操，這是第二件讓我痛快的事。而且他決策謀劃的見識，遠勝過戰國的張儀、蘇秦；後來雖然勸我把土地借給劉備，這是他的一個短處，但不足以損害他的兩個長處。周公不要求一個人完美無缺，所以我忽略他的短處而看重他的長處，常把他比作東漢的鄧禹。再說子明（呂蒙）年輕時，我以為他隻是不畏艱難，果敢有膽識而已；等到他長大成熟，學問日益精深，謀略奇絕，已能僅次於公瑾，隻是言談議論的英氣不如公瑾罷了。他謀劃攻取關羽，這方麵勝過子敬。子敬曾給我寫信說‘帝王興起，都要先清除障礙，關羽不值得忌憚。’這是子敬自己做不到，卻在表麵說大話，我也原諒他，沒有過分責備。不過他治軍紮營，能做到令行禁止，轄區內沒有失職違法的事，路不拾遺，他的治軍方法也很好。”
    評論說曹操憑借漢朝丞相的身份，挾持天子掃蕩各路英雄，剛剛平定荊州，依仗威勢進軍江東，當時議論的人沒有不疑慮動搖的。周瑜、魯肅展現出獨到的決斷和過人的見識，實在是難得的奇才。呂蒙勇猛且有謀略，能判斷識別軍事大計，用計收服郝普，活捉關羽，這是他最精妙的戰績。起初他雖然輕率果斷、隨意殺人，但最終能約束自己，有國士的器量，難道隻是個武將而已嗎！孫權對他們的評價，優劣恰當，所以記錄在這裏。
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