呂布無法確定自己與董卓小妾私通之事有沒有被董卓發現。但董卓後來曾當著眾人之麵向他扔過一次戟，想殺了他。這不由讓呂布心生暗鬼：董卓是不是發現自己的奸情了呢？那該怎麽辦？

    有一次，呂布在王允麵前說起這件事，王允一聽便笑了。因他知道：機會終於來了！自己所做的這一切，就是為了今天。

    王允決定：將他要刺殺董卓的計劃向呂布和盤托出。並說隻要呂將軍你肯做內應，董卓必可除去。

    呂布聽後卻歎息一聲“我實在下不了手呀。畢竟我和他還有父子之情”王允笑道“將軍姓呂，太師姓董，你們本就不是親骨肉。況且他拿戟擲你之時，有沒有考慮過你們有父子之情呢”此話一出，呂布終於答應參加刺董計劃。

    4月23日，漢獻帝劉協剛生完一場病。痊愈後，便準備在未央殿大會群臣。

    對董卓來說，這是一個詭異的日子。他早早起床，穿好朝服，準備出門。然而剛上馬車，他的馬就驚叫起來，把董卓摔下車去，還滾了一身泥。無奈隻好回家換過衣服，再準備出門。

    這時，董卓少妻告訴他“這個兆頭不好，你還是別出門了”董卓笑笑“怕什麽呢”說完就出去了。

    事實證明女人的感覺是相當靈敏的。少妻警告董卓，不是沒道理的。當然董卓也不是全不在意。之前就發生過黃門侍郎荀攸、尚書鄭泰、侍中種輯等人想要刺殺他，結果事情敗露，荀攸下獄，鄭泰逃奔袁術。

    為防止有刺殺事件出現，董卓把安保工作做得相當到位：身穿重甲。左邊步兵右邊騎兵，替他開道。還有呂布跟在身邊，重重保護。可謂密不透風，萬無一失。

    董卓出門路上，聽到有一群小孩在唱著童謠“千裏草，何青青。十日卜，不得生”董卓不明其意。其實“千裏草”正是“董”字、“十日卜”又是“卓”字，這童謠正是咒董卓不得生呢。

    繼續向前走，董卓又見到一個道士穿著布衣，上麵寫著一個大大的“呂”字，沿路唱歌。歌詞很簡單，就隻有兩個字“布乎”董卓見了也莫名其妙，不知這其中到底有什麽玄機…

    所以說：上天想要你死，逃是逃不掉的！此時，王允已命士孫瑞寫好了誅殺董卓的詔書，交給了呂布，又命李肅率秦誼、陳衛等十餘個勇士偽裝成衛士，埋伏在北掖門內。

    可誰也沒想到：剛到北掖門，董卓的馬又惹事了。董卓想進門，可那馬像是被嚇住了，死活不向前。這下董卓警惕起來了，對身邊的呂布道“今天是啥日子？我的馬屢屢受驚，要不就先別進去了”

    呂布馬上勸道“來都來了，就進去吧。百官現在也應都到齊了，就差您了”

    董卓想想也對。皇帝生病這些天來，自己好久沒上朝了。怎麽說也該見見文武百官了。還有，就算出什麽事，不是還有呂布在自己身邊保護著嗎？

    董卓遲疑了一會，就進門了。然而他一進去就後悔了。隻見李肅持戟躍起，直刺向他。

    董卓甲衣質量不錯，這一戟沒穿進去，然而卻把他嚇得夠嗆，從車上摔了下來。當他爬起來後，立即本能的大呼“呂布何在”呂布順聲應道“布奉詔討賊”董卓這才知道壞大事了，不由得大罵“庸狗敢動我”

    都這個時候了，有什麽不敢動的？呂布上前一矛就將董卓刺死。主簿田儀、董卓的倉頭上前想搶董卓的屍體，也被呂布殺死。隨後，呂布從懷中取出士孫瑞先前寫好的詔書大聲宣讀“隻誅賊臣董卓一人，餘皆不問”

    不可一世的董卓就這樣倒下了。正應了一句古話：多行不義必自斃。

    董卓被殺的消息，迅速傳遍了長安城。整個長安城都沉浸在歡樂的海洋中。吏士沿路高喊萬歲。百姓在街道上跳起了舞。更誇張的是：那些逛街的婦女來不及回家取錢，當場就把身上的珠玉衣裝給典賣了，買酒狂歡。這一天，長安酒樓的生意是最好的，到處都是痛快的喝酒聲。

    緊接著，皇甫嵩也出動了。他率兵殺進郿塢，去誅殺董卓家族。董旻、董璜，甚至董卓90歲的老母親一個都沒放過，全部斬首。又從郿塢中搜出金二三萬斤，銀八九萬斤，錦綺奇玩無數，全部搬回皇宮。

    最後，董卓的屍體則被拖到長安大街上示眾。陰曆4月23日天氣已漸漸轉熱，董卓又肥，他身上的油脂流了一地。有好事者找來一根燈芯，插進董卓的肚臍點燃。據說竟然亮了整整一天，可謂長安奇觀。袁氏的門生故吏還將董氏一族的屍體全部搬至袁氏墓前，將其焚骨揚灰。

    董卓燃滅了自己，卻沒能照亮大漢朝的黑夜。那些街頭狂歡的百姓們，以為他們的冬天即將過去，春天即將到來，但他們沒想到：長夜才剛剛降臨，更殘酷的殺戮正徐徐拉開於黑沉沉的大地之上…

    隨後，漢獻帝劉協下詔：司徒王允錄尚書事，總理朝政。封呂布為奮威將軍、假節、儀比三司、溫侯。派張種為使者，前往撫慰關東各諸侯。

    董卓死後，先前因刺殺董卓密謀敗露而下獄的荀攸被從獄裏放出。而曾被董卓重用的一代文宗蔡邕卻被牽連而死於獄中。

    當時，蔡邕在聽到董卓的死訊後驚歎了一聲，坐在他旁邊的王允立即翻臉“董卓逆賊。幾亡漢室。今日伏誅，普天同慶。君為漢臣，卻顧念董卓私遇，流露傷痛。莫非同為逆黨嗎？應交付廷尉審訊”蔡邕立即謝罪道“邕身雖不忠，古今大義，自也知曉。豈會背國而向卓？隻是聽到董氏全族被誅，一時生感，遂至歎息。蔡邕知錯。願受黥首刖足之刑，隻求不要殺我。因如今我正在寫作《東觀漢紀》這部史書，我想把它寫完”

    百官也紛紛為蔡邕求情。太尉馬日磾專門來見王允“蔡邕曠世逸才，又熟識漢事，他寫的漢史定能成一代大典。今雖有罪，也尚不至於判其死刑。不如就依他所請，懲以小戒，讓他寫完漢史吧”沒想到王允卻堅決反對，還舉了一個例子“當年司馬遷為李陵辯護而觸怒漢武帝，漢武帝卻沒殺他，還讓他寫成了一部謗書(即二十四史之首的《史記》)流於後世。如今國祚中衰，四方動亂，若再使佞臣伴侍幼主，執筆舞文，不但無補聖德，亦會使我輩蒙受訕議”聽到王允這番話，實在不得不讓人慶幸王允沒能生在武帝時代，要不然司馬遷還能活嗎？《史記》還會流傳後世嗎？事實也正說明王允殺蔡邕不僅是冤案，且影響極其惡劣。一個月後，董卓部將之所以造反，血洗長安，甚至王允本人都被殺，直接原因就是王允此時對蔡邕的大開殺戒！

    馬日磾聽到這番‘欲加之罪何患無辭’的說法之後，不禁也搖頭歎息“王公恐命不久矣。善人，國之紀也。製作，國之典也。如今王公卻要殺蔡邕、毀史書，滅紀廢典，這是天不佑他啊”最後蔡邕慘死於獄中。

    4月，百萬青州黃巾軍入寇兗州，兗州刺史劉岱不聽濟北國國相鮑信的勸諫，出兵與戰，結果在東平國兵敗被殺。消息傳到東郡，曹操的部將陳宮立即認識到這是一天賜良機。就像袁紹占據冀州一樣，曹操也需要一塊根據地。陳宮自告奮勇，願前往兗州，遊說別駕、治中等人，讓曹操入主兗州。

    鮑信等人被陳宮說動，派了一個叫萬潛的州吏前往東郡，迎接曹操來擔任兗州刺史。曹操率兵在東平國壽張縣東與黃巾軍激戰。先敗後勝，終於站穩腳跟。不過鮑信在此戰中不幸戰死。身在長安的漢獻帝劉協又派來一個叫金尚的人來做兗州刺史，曹操絲毫不給麵子，直接把人趕走，去投奔袁術去了。

    5月10日，漢獻帝劉協大赦天下。20日，征西將軍皇甫嵩被任命為車騎將軍。

    雖然大赦天下，但對董卓舊部該如何處置，呂布、王允等人卻意見不同。呂布認為要盡殺之。王允反對“此輩無罪。不可”呂布又提出要將從郿鄔搜出的董卓搜刮到的財物賞賜文武百官，王允又不同意。二人雖同執朝政，但王允始終把呂布看成一介武夫，呂布則自恃誅董之功，多自誇伐，二人漸生嫌隙。

    王允與士孫瑞商議，準備頒詔，特赦董卓舊部。突然又反悔起來“這群逆黨，不應輕赦。還是等將來再說吧”又有人勸王允應將董卓這支部隊交由皇甫嵩統領，駐守陝州。王允也有顧慮“今若距險屯陝，雖可安涼州士兵，卻會疑關東諸侯之心。不可也”

    就在王允的遲疑，一股流言正不脛而走，傳的沸沸揚揚，說朝廷準備盡誅涼州之人。而呂布的行動仿佛更證實了這一流言。呂布命李肅前往陝縣，去殺正在那裏的董卓女婿牛輔。不過李肅沒有打過牛輔，兵敗後逃往弘農郡，被呂布殺掉。牛輔也知如今情況不妙，趕走李肅後就踏上了逃亡之路。不過沒等他逃出多遠，就被自己的左右所殺。

    這一流言嚇壞了董卓的舊部。尤以三個月前奉命往河南中牟去擊退朱俊的李傕、郭汜、張濟三將為最。他們遣使往長安，請求朝廷特赦。但被王允一口拒絕“剛剛才大赦過天下。一歲不可再赦”這下糟糕了。連蔡邕這樣僅僅為董卓之死歎息了一聲的士大夫都要被殺，何況我們這些本就是董卓的舊部呢？三將商量下來，決定解散部隊，各自逃歸鄉裏。

    然而，這時有一個人的突然出現打亂了曆史的進程，讓這場天下大亂愈發的不可收拾：討虜校尉賈詡對三將說“你們若放棄兵權，那能逃到哪裏？一個亭長也足以收拾你們。你們不如以‘為董公報仇’為名，西行攻打長安。若是成功，則奉天子以正天下。若失敗了，再逃也不遲啊”

    就這樣，李傕、郭汜、張濟三將聽從了賈詡的建議，率領數千兵馬，往長安殺去。一開始，王允也沒放在心上，派了手下的兩個涼州人：胡文才、楊整修前去勸釋。可沒想到這二人一見三將，便將長安城內王允與呂布不和之事全盤托出，並要三將火速進兵。

    三將一路上收容董卓舊部，到達長安城下時，又與樊稠、李蒙二人會合，此時已有眾10餘萬。但長安城城防堅固，叛軍連攻八日都沒能得手。6月1日，因有來自於蜀地的呂布部下內反，打開長安城門，引叛軍入城。呂布憑一己之勇，率數百騎與叛軍交戰。終因寡不敵眾，呂布將董卓的首級係在馬上，便逃出長安城去。經過青瑣門時，招王允一同逃跑。王允拒絕“若蒙社稷之靈，上安國家，吾之願也。如其不獲，則奉身以死之。朝廷幼少，恃我而已。臨難苟免，吾不忍也。努力謝關東諸公，勤以國家為念”

    太常種拂、太仆魯馗、大鴻臚周奐、城門校尉崔烈、越騎校尉王頎等多人在這場動亂中被殺。官吏百姓死者萬餘人，狼藉滿道。